Sanitation of apple using NGS diagnostics
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F23%3AN0000012" target="_blank" >RIV/25271121:_____/23:N0000012 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Ozdravování jabloní s využitím diagnostiky NGS
Original language description
Cílem práce bylo ověřit nové přístupy k produkci ozdraveného množitelského materiálu jabloní s využitím moderních metod sekvenování nové generace. Probíhalo stanovení přítomnosti virů uvedených ve stávajícím certifikačním schématu EPPO a nových neznámých virů a viroidů. Výsledky diagnostiky prokázaly, že testované odrůdy udržované v technickém izolátu a podnože M9 byly prosté virů uvedených v certifikačním schématu EPPO pro jabloně, a tedy splňují kvalitativní požadavky na rozmnožovací materiál dle standardu EPPO a certifikace „virus-free“. V odrůdách jabloně byly ale zjištěny sekvence patogenů Apple hammerhead viroid, dále pak ilarvirus a Citrus concave gum-associated virus. V případě rostlin podnože M9 byl zjištěn zatím nepopsaný virus, pojmenovaný Apple associated virus 1, s podobností sekvencí s Tomato matilda-associated virus. Po ozdravovacích procedurách se podařilo získat rostliny, které byly po testování negativní na viry detekované v mateřských rostlinách. Dosažené výsledky prokazují velký potenciál technologie NGS pro zjištění virů a viroidů při certifikaci zdravotního stavu a ozdravování vegetativně množených plodin.
Czech name
Ozdravování jabloní s využitím diagnostiky NGS
Czech description
—
Classification
Type
J<sub>ost</sub> - Miscellaneous article in a specialist periodical
CEP classification
—
OECD FORD branch
10607 - Virology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1910065" target="_blank" >QK1910065: New approaches to the production of certified varieties of apple trees using NGS diagnostics of pathogens</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2023
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Zahradnictví
ISSN
1213-7596
e-ISSN
—
Volume of the periodical
22
Issue of the periodical within the volume
6
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
3
Pages from-to
10-12
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—