DNA Sample Collection System
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26162539%3A_____%2F19%3AN0000001" target="_blank" >RIV/26162539:_____/19:N0000001 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.cmsch.cz/getattachment/05e7241f-e61b-4839-8d4c-6d12e83a24f8/Metodika-k-certifikaci_NAZV-QK1910217_-2019prasata.pdf.aspx?lang=cs-CZ" target="_blank" >https://www.cmsch.cz/getattachment/05e7241f-e61b-4839-8d4c-6d12e83a24f8/Metodika-k-certifikaci_NAZV-QK1910217_-2019prasata.pdf.aspx?lang=cs-CZ</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Systém odběru vzorků DNA
Original language description
Cílem metodiky je: - V návaznosti na aktuální vývoj metod molekulárně genetických analýz genomu prasat definovat kritéria volby biologického vzorku určeného k izolaci genomické DNA vhodné pro aplikaci v SNP technologiích, zejména pak k analýzám na microarray´s – PorcineSNP60 v2 BeadChips Illumina. - Tradiční biologické zdroje – obvykle odběr nesrážlivé krve – nahradit neinvazivním odběrem inovativních zdrojů DNA, umožňujícím zachování welfare zvířat, souběžně s eliminací dodatečných nákladů na odběr, uchovávání a transport odebraných vzorků. - Zdůvodnit výběr inovativního biologického zdroje (zdrojů) DNA a doložit důvody jeho primární volby z hlediska účelně stanovených kritérií. - Při specifikaci kritérií volby zdroje DNA vycházet z potřeby nekonfliktního a komfortního provedení odběru zdroje DNA v podmínkách chovatelské praxe a souběžně zohlednit nároky na zpracování zdrojů DNA v rutinní servisní laboratoři, s možností uplatnit tzv. industry model průchodnosti vzorků laboratoří, potřebu automatizace metod izolace DNA a využití robotických zařízení. - Vyvinout a odzkoušet odběrovou sadu/sady pro vytipovaný zdroj/zdroje DNA, nebude-li vhodná odběrová sada komerčně dostupná. - Nabídnout chovatelům prasat a zainteresovaným organizacím jednoduchý postup, podle kterého budou v chovech prasat plošně odebírány standardizované biologické vzorky do optimalizovaných odběrových sad. - Pro potřeby tvorby referenční populace rozpracovat metody izolace genomické DNA z nestandardních biologických zdrojů – reziduální a archivní zdroje, pro případy, kdy není k dispozici zdroj standardní. - Výběrem vhodných zdrojů DNA, vypracováním postupu odběru, vývojem odběrové sady pro vybraný zdroj(e) DNA komplexně optimalizovat proces odběru a snížit riziko nutnosti opakování odběrů zdrojů DNA. - Definovat postup pro primární kontrolu kvality izolované DNA s ohledem na potřebu vyřazení nekvalitních extraktů DNA z analytických procesů ještě před aplikací na microarray´s tak, aby se minimalizovaly neúčelně vynaložené náklady. - Sofistikovaným odběrem biologického vzorku a primární kontrolou kvality izolované DNA před zařazením do genomických SNP analýz eliminovat předvídatelné příčiny absence výsledků SNP genotypizace, která vede k předražení SNP microarray´s analýz, ke zpomalení plošné SNP genotypizace prasat a v konečném důsledku limituje využití potenciálů genomických analýz v procesu šlechtění prasat.
Czech name
Systém odběru vzorků DNA
Czech description
Cílem metodiky je: - V návaznosti na aktuální vývoj metod molekulárně genetických analýz genomu prasat definovat kritéria volby biologického vzorku určeného k izolaci genomické DNA vhodné pro aplikaci v SNP technologiích, zejména pak k analýzám na microarray´s – PorcineSNP60 v2 BeadChips Illumina. - Tradiční biologické zdroje – obvykle odběr nesrážlivé krve – nahradit neinvazivním odběrem inovativních zdrojů DNA, umožňujícím zachování welfare zvířat, souběžně s eliminací dodatečných nákladů na odběr, uchovávání a transport odebraných vzorků. - Zdůvodnit výběr inovativního biologického zdroje (zdrojů) DNA a doložit důvody jeho primární volby z hlediska účelně stanovených kritérií. - Při specifikaci kritérií volby zdroje DNA vycházet z potřeby nekonfliktního a komfortního provedení odběru zdroje DNA v podmínkách chovatelské praxe a souběžně zohlednit nároky na zpracování zdrojů DNA v rutinní servisní laboratoři, s možností uplatnit tzv. industry model průchodnosti vzorků laboratoří, potřebu automatizace metod izolace DNA a využití robotických zařízení. - Vyvinout a odzkoušet odběrovou sadu/sady pro vytipovaný zdroj/zdroje DNA, nebude-li vhodná odběrová sada komerčně dostupná. - Nabídnout chovatelům prasat a zainteresovaným organizacím jednoduchý postup, podle kterého budou v chovech prasat plošně odebírány standardizované biologické vzorky do optimalizovaných odběrových sad. - Pro potřeby tvorby referenční populace rozpracovat metody izolace genomické DNA z nestandardních biologických zdrojů – reziduální a archivní zdroje, pro případy, kdy není k dispozici zdroj standardní. - Výběrem vhodných zdrojů DNA, vypracováním postupu odběru, vývojem odběrové sady pro vybraný zdroj(e) DNA komplexně optimalizovat proces odběru a snížit riziko nutnosti opakování odběrů zdrojů DNA. - Definovat postup pro primární kontrolu kvality izolované DNA s ohledem na potřebu vyřazení nekvalitních extraktů DNA z analytických procesů ještě před aplikací na microarray´s tak, aby se minimalizovaly neúčelně vynaložené náklady. - Sofistikovaným odběrem biologického vzorku a primární kontrolou kvality izolované DNA před zařazením do genomických SNP analýz eliminovat předvídatelné příčiny absence výsledků SNP genotypizace, která vede k předražení SNP microarray´s analýz, ke zpomalení plošné SNP genotypizace prasat a v konečném důsledku limituje využití potenciálů genomických analýz v procesu šlechtění prasat.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
—
Continuities
N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
systém odběru vzorků DNA
Regulation ID
6995/2019-ČPI
Technical parameters
Smlouva o uplatnění certifikované metodiky č. ISBN: 978-80-87633-03-8 zpracované v rámci řešení výzkumného projektu Ministerstva zemědělství č. NAZV QK1910217 uzavřená mezi: Českomoravská společnost chovatelů a.s. se sídlem Benešovská 123, 252 09 Hradištko IČ: 26162539 DIČ: CZ26162539 zastoupená doc. Dr. Ing. Josefem Kučerou, výkonným místopředsedou představenstva (poskytovatel metodiky) a CBS - Czech Breeding Services s.r.o. se sídlem Komenského 221, 783 73 Grygov, IČ: 01383728, DIČ: CZ01383728 zastoupená Ing. Ladislavem Škařupou, ředitelem (uživatel metodiky) Osvědčení č. 6995/2019-ČPI vydala Česká plemenářská inspekce se sídlem Slezská 100/7, Praha 2, 120 00 dne 3.9.2019
Economical parameters
Podle zákona č. 110/1997 Sb. O potravinách a zákona č. 154/2000 Sb. O šlechtění, plemenitbě a evidenci hospodářských zvířat ve znění pozdějších předpisů je ČMSCH, a.s. jako osoba pověřená Ministerstvem zemědělství ČR k výkonu činností podle jednotlivých bodů, povinna poskytovat spolu s plemennou knihou chovatelům a oprávněným osobám údaje, zpracovávat, zveřejňovat a evidovat výsledky, což se týká všech chovatelsky důležitých vlastností. Předpokládané ekonomické přínosy metodiky jsou kalkulovány až do výše 980,- Kč za jeden vzorek dodaný do laboratoře ve standardizovaném formátu. Jako přínos je nutno hodnotit i snížení administrativní zátěže personálu laboratoře při vyřizování žádostí o dodání nového vzorku biologického materiálu. Dalšími přínosy předkládané metodiky je rozšíření spektra technik a metodických postupů používaných v laboratoři iGenetiky. Přínosem pro uživatele metodiky je zajištění uceleného návodu pro získání biologického vzorku potřebné kvality.
Certification body designation
Česká plemenářská inspekce se sídlem Slezská 100/7, Praha 2, 120 00
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů