CHARACTERIZATION OF GENETIC DIVERSITY AND STRUCTURE ANALYSIS WITHIN PEA (Pisum sativum L.) GERMPLASM AT AGRITEC LTD. COLLECTION.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26784246%3A_____%2F07%3A%230000048" target="_blank" >RIV/26784246:_____/07:#0000048 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

CHARACTERIZATION OF GENETIC DIVERSITY AND STRUCTURE ANALYSIS WITHIN PEA (Pisum sativum L.) GERMPLASM AT AGRITEC LTD. COLLECTION.

Original language description

The 164 accessions representing Czech and Slovak varieties bred over last 50 years were selected for evaluation of genetic diversity in this study. These were characterized by 42 morphological descriptors in two growth seasons, and DNA of bulk made from10 plants per accession was investigated by several molecular markers, including microsatellite SSR and retrotransposon-based markers. In total, 12 selected SSRs, 25 RBIP markers and 2 IRAP markers produced altogether 56 scorable polymorphic data pointsfor each accession. To enable integration and evaluation of all data in one analysis, Bayesian method using BAPS software was applied. The most informative and the best corresponding to pedigree showed the consecutive calculation first by morphological follow by molecular data. Division into 3 distinct breeding periods has revealed significant decrease in genetic diversity over time.

Czech name

Charakterizace genetické struktury kolekce hrachu (Agritec Ltd.)

Czech description

Byla studována genetciká diverzita 164 položek hrachu českého a slovenského původu pomocí 12 SSR, 25 RBIP a 2 IRAP molekulárních markerů, společně s 42 morfologickými deskriptory. Získaná data byla analyzována pomocí výpočtu genetických vzdáleností a následné shlukové analýzy. Morfologická data takto rozdělily studovaný soubor na 5 až 7 shluků, zatímco molekulární pak na 6 až 7. Pro možnost integrace abou systémů byla využita Bayesiánská analýza pomocí BAPS software, jež vyústila v postupné odlišení shluků. Rozdělení souboru dle šlechtiteslkých period pak naznačilo existenci zůžení genetického spektra.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Plant genetic resources and their exploitation in the plant breeding for food and agriculture.

ISBN

978-80-88872-63-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

54-55

Publisher name

—

Place of publication

Piešťany, Slovensko

Event location

Piešťany, Slovensko

Event date

Jan 1, 2007

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—