Optimal donor search using DNA typing data
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F13%3A43920563" target="_blank" >RIV/49777513:23520/13:43920563 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/vyhledavani_DNA" target="_blank" >http://www.kky.zcu.cz/cs/sw/vyhledavani_DNA</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Výběr optimálního dárce s využitím dat DNA typizace
Original language description
Jedná se o prototypové řešení vyhledávání potenciálně shodných dárců kostní dřeně využivající pravděpodobnostní modely haplotypů a genotypů nepříbuzných jedinců a HLA shod pacient-dárce. Řešení zahrnuje implementaci potřebného rozkladu variant antigenů pro všechny lokusy (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1) v závislosti na rozlišení typizace (rozklad NMDP, MAC kódů), vypořádání se se sérologickými daty, identifikované pravděpodobnostní modely všech možných haplotypů a genotypů pomocí EM algoritmu, možnosti volby požadovaných kritérií (např. požadovanou HLA shodu 10/10, 9/10 HLA-A mismatch (neshoda) , 7/8 HLA-C mismatch) .
Czech name
Výběr optimálního dárce s využitím dat DNA typizace
Czech description
Jedná se o prototypové řešení vyhledávání potenciálně shodných dárců kostní dřeně využivající pravděpodobnostní modely haplotypů a genotypů nepříbuzných jedinců a HLA shod pacient-dárce. Řešení zahrnuje implementaci potřebného rozkladu variant antigenů pro všechny lokusy (HLA-A/B/C/DRB1/DQB1) v závislosti na rozlišení typizace (rozklad NMDP, MAC kódů), vypořádání se se sérologickými daty, identifikované pravděpodobnostní modely všech možných haplotypů a genotypů pomocí EM algoritmu, možnosti volby požadovaných kritérií (např. požadovanou HLA shodu 10/10, 9/10 HLA-A mismatch (neshoda) , 7/8 HLA-C mismatch) .
Classification
Type
G<sub>prot</sub> - Prototype
CEP classification
IN - Informatics
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TA01010342" target="_blank" >TA01010342: Research and development of advanced IT technologies for support of bone marrow donor searching for transplantation</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2013
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
DNA prototyp
Numerical identification
—
Technical parameters
Eduard Janeček, Univerzitní 8, 301 00 Plzeň, email: janecek@kky.zcu.cz, tel. +420 377 632 506
Economical parameters
Prototyp je plánovaným výstupem projektu TA01010342, jehož ekonomický přínos je definován jako relevantní podíl přínosů projektu. Výsledek umožní zvýšení objemu a zisku v aplikovaném výzkumu, přesnější vyhledání vhodného dárce, a tím finanční úsporu a urychlení transplantačního procesu.
Application category by cost
—
Owner IČO
49777513
Owner name
Západočeská univerzita v Plzni
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence
Licence fee requirement
A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek
Web page
—