Optimization methods loop-mediated isothermal amplification to detect the bacteria Xanthomonas vesicatoria
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12220%2F16%3A43892028" target="_blank" >RIV/60076658:12220/16:43892028 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Optimalizace metody loop-mediated isothermal amplification pro detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria
Original language description
Předmětem této práce je využití metody loop-mediated isothermal amplification (LAMP) pro polní detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria, která způsobuje bakteriální skvrnitost rajčat a paprik. V průběhu optimalizace metody bylo vybráno 10 genových sekvencí, u kterých probíhal samotný návrh pomocí softwaru PrimerExplorer verze 5. Z navržených primerů bylo několik sad vybráno do laboratorního testování. Na základě provedených experimentů byla navržena jedna sada primerů s názvem XvefP, která byla dále syntetizována a optimalizována pro rutinní detekci X. vesicatoria metodou LAMP.
Czech name
Optimalizace metody loop-mediated isothermal amplification pro detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria
Czech description
Předmětem této práce je využití metody loop-mediated isothermal amplification (LAMP) pro polní detekci bakterie Xanthomonas vesicatoria, která způsobuje bakteriální skvrnitost rajčat a paprik. V průběhu optimalizace metody bylo vybráno 10 genových sekvencí, u kterých probíhal samotný návrh pomocí softwaru PrimerExplorer verze 5. Z navržených primerů bylo několik sad vybráno do laboratorního testování. Na základě provedených experimentů byla navržena jedna sada primerů s názvem XvefP, která byla dále syntetizována a optimalizována pro rutinní detekci X. vesicatoria metodou LAMP.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2016
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Volume of the periodical
12
Issue of the periodical within the volume
LXIV
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
4
Pages from-to
281-284
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—