Design and testing of primers specific for detection of quarantine bacterium Xanthomonas vesicatoria
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F11%3A00370246" target="_blank" >RIV/60077344:_____/11:00370246 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/60076658:12220/11:43882094
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Návrh a testování specifických primerů pro detekci karanténní bakterie Xanthomonas vesicatoria
Original language description
V této studii popisujeme vývoj metody PCR pro detekci karanténní bakterie Xanthomonas vesicatoria, která je patogenní pro rajče a papriku. Pár primerů XV1F a XV1R byl navržen na základě DNA sekvence genu atpD (získané ze sbírkového kmenu Xv CCM 2102) tak, aby byl specifický pouze pro detekci Xanthomonas vesicatoria. Tyto námi navržené primery poskytovaly (výsledný) amplifikační produkt o velikosti 356 bp a rovněž vykazovaly vysokou specifičnost. Při testování primerů na specifičnost soubor testovaných bakterií zahrnoval mnoho bakterií patogenních pro rajče a papriku (včetně rodu Xanthomonas) a některé další bakterie. K pozitivní PCR reakci však docházelo pouze tehdy, byla.-li použita templátová DNA vyizolovaná z Xanthomonas vesicatoria. Dodržením protokolu popsaném v tomto článku lze rychle a spolehlivě identifikovat bakterii Xanthomonas vesicatoria. Dle dostupných informací se jedná o první dvojici primerů, detekující specificky pouze bakteriální druh Xanthomonas vesicatoria.
Czech name
Návrh a testování specifických primerů pro detekci karanténní bakterie Xanthomonas vesicatoria
Czech description
V této studii popisujeme vývoj metody PCR pro detekci karanténní bakterie Xanthomonas vesicatoria, která je patogenní pro rajče a papriku. Pár primerů XV1F a XV1R byl navržen na základě DNA sekvence genu atpD (získané ze sbírkového kmenu Xv CCM 2102) tak, aby byl specifický pouze pro detekci Xanthomonas vesicatoria. Tyto námi navržené primery poskytovaly (výsledný) amplifikační produkt o velikosti 356 bp a rovněž vykazovaly vysokou specifičnost. Při testování primerů na specifičnost soubor testovaných bakterií zahrnoval mnoho bakterií patogenních pro rajče a papriku (včetně rodu Xanthomonas) a některé další bakterie. K pozitivní PCR reakci však docházelo pouze tehdy, byla.-li použita templátová DNA vyizolovaná z Xanthomonas vesicatoria. Dodržením protokolu popsaném v tomto článku lze rychle a spolehlivě identifikovat bakterii Xanthomonas vesicatoria. Dle dostupných informací se jedná o první dvojici primerů, detekující specificky pouze bakteriální druh Xanthomonas vesicatoria.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QH71229" target="_blank" >QH71229: Diagnostics and methods of protection against quarantine and other economically important pathogens of fruit and leafy vegetables</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2011
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Volume of the periodical
12
Issue of the periodical within the volume
—
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
4
Pages from-to
205-208
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—