The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00087493" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00087493 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/07:00008005

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing

Original language description

The complex Leishmania donovani is comprised of L. donovani (LD), L. infantum (LI) and L. archibaldi (LA). Morphological distinction of species is impractical, so biochemical, immunological and DNA-based criteria were introduced. Multilocus enzyme electrophoresis (MLEE) is the present gold standard. We have sequenced the genes encoding 5 metabolic enzymes used for MLEE, both to resolve the DNA diversity underlying isoenzyme mobility differences and to explore the potential of these targets for higher resolution PCR-based multilocus sequence typing. The genes sequenced were isocitrate dehydrogenase, malic enzyme, mannose phosphate isomerase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and fumarate hydratase, for 17 LI strains, 7 LD strains , and 3 LA strains. Phylogenetic analysis of a concatenated alignment based on a total of 263 kb protein-coding sequences showed strong correlation of genotype with geographical origin. Europe and Africa appear to represent independent evolutionary centres.

Czech name

Komplex Leishmania donovani: genotypy pěti metabolických enzymů (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), nových cílů multilokálního sekvenčního typování

Czech description

Komplex Leishmania donovani se skládá z L. donovani, L. infantum a L. archibaldi, ačkoli posledně jmenovaný zástupce není považován za validní druh. Rozlišení leishmánií na základě morfologie není možné; používají se biochemické, imunologické a molekulárně biologické přístupy. Multilokální enzymová elektroforéza (MLEE) je v současnosti tzv. zlatým standardem. Sekvenovali jsme geny kodující 5 metabolických enzymů používaných pro MLEE, a to pro rozlišení DNA diverzity příslušných isozymů a rovněž pro posouzení jejich vhodnosti pro multilokální sekvenování na bázi PCR. U 17 kmenů L. infantum, 7 kmenů L. donovani a 3 kmenů L. archibaldi byly sekvenovány geny pro isocitrate dehydrogenázu, jablečný enzym, manosofosfát isolerázu, glukoso-6-fosfát dehydrogenázu a fumarát hydratázu. Fylogenetická analýza založená na 263 kb protein-kodujících sekvencí ukázala silnou korelaci mezi genotypem a geografickým původem. Evropa a Afrika představují na základě našich výsledků nezávislá evoluční centra.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/2B06129" target="_blank" >2B06129: Model organisms as a key to the understanding of functions of disease-related human genes</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>R - Projekt Ramcoveho programu EK

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

International Journal for Parasitology

ISSN

0020-7519

e-ISSN

—

Volume of the periodical

37

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

AU - AUSTRALIA

Number of pages

12

Pages from-to

149-160

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—