Methodology for detection of Potato virus Y in leaves and tubers using PCR-based methods

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F20%3AN0000023" target="_blank" >RIV/60109807:_____/20:N0000023 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://www.vubhb.cz" target="_blank" >http://www.vubhb.cz</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Metodika detekce Y viru bramboru (Potato virus Y) v listech a hlízách pomocí metod založených na PCR

Original language description

Cílem certifikované metodiky bylo optimalizovat molekulárně-biologické laboratorní metody detekce a determinace hospodářsky nejvýznamnějšího viru lilku bramboru (Solanum tuberosum L.), tj. Y viru bramboru (Potato virus Y – PVY). Použité metody založené na PCR (TaqMan real-time RT-PCR a SybrGreen real-time RT-PCR) zvýší citlivost detekce PVY v listech a hlízách bramboru, zajistí vyšší spolehlivost diagnostiky a významně urychlí výsledky. Protokoly byly optimalizovány pro použití v běžné diagnostické laboratoři vybavené zařízením pro molekulární biologii. V metodice jsou uvedeny podrobné ověřené a optimalizované laboratorní manuály postupů rutinní detekce PVY v pletivech bramboru pomocí exaktních metod na molekulární úrovni, které zahrnují odběr vzorků, izolaci RNA, vlastní postup přípravy reakcí, kontrolu specificity a vyhodnocení výsledků. Kvalitu extrahované RNA a vznik možných falešně negativních výsledků lze snadno kontrolovat pomocí interního standardu zařazeného do testů. Certifikovaná metodika je určená pro pracoviště, která se zabývají diagnostikou patogenů rostlin, především pro šlechtitelské organizace, výzkumné ústavy, diagnostické laboratoře státní správy a případně zemědělskou praxi. Včasná a citlivá detekce PVY pomocí metod založených na PCR ve výchozích šlechtitelských materiálech bramboru přispěje k eliminaci infekce zamezením dalšího přenosu a tím ke snížení ekonomických ztrát dané šlechtitelské organizace. Zdravý sadbový materiál patří k nejdůležitějším způsobům eliminace virů.

Czech name

Metodika detekce Y viru bramboru (Potato virus Y) v listech a hlízách pomocí metod založených na PCR

Czech description

Cílem certifikované metodiky bylo optimalizovat molekulárně-biologické laboratorní metody detekce a determinace hospodářsky nejvýznamnějšího viru lilku bramboru (Solanum tuberosum L.), tj. Y viru bramboru (Potato virus Y – PVY). Použité metody založené na PCR (TaqMan real-time RT-PCR a SybrGreen real-time RT-PCR) zvýší citlivost detekce PVY v listech a hlízách bramboru, zajistí vyšší spolehlivost diagnostiky a významně urychlí výsledky. Protokoly byly optimalizovány pro použití v běžné diagnostické laboratoři vybavené zařízením pro molekulární biologii. V metodice jsou uvedeny podrobné ověřené a optimalizované laboratorní manuály postupů rutinní detekce PVY v pletivech bramboru pomocí exaktních metod na molekulární úrovni, které zahrnují odběr vzorků, izolaci RNA, vlastní postup přípravy reakcí, kontrolu specificity a vyhodnocení výsledků. Kvalitu extrahované RNA a vznik možných falešně negativních výsledků lze snadno kontrolovat pomocí interního standardu zařazeného do testů. Certifikovaná metodika je určená pro pracoviště, která se zabývají diagnostikou patogenů rostlin, především pro šlechtitelské organizace, výzkumné ústavy, diagnostické laboratoře státní správy a případně zemědělskou praxi. Včasná a citlivá detekce PVY pomocí metod založených na PCR ve výchozích šlechtitelských materiálech bramboru přispěje k eliminaci infekce zamezením dalšího přenosu a tím ke snížení ekonomických ztrát dané šlechtitelské organizace. Zdravý sadbový materiál patří k nejdůležitějším způsobům eliminace virů.

Type

N_metC - Methodology certified by the authorised body

CEP classification

—

OECD FORD branch

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Project

—

Continuities

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2020

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

praktické informace č. 82

Regulation ID

UKZUZ 224027/2020

Technical parameters

Byla uzavřena smlouva o implementaci metodiky se společností Vesa Velhartice a.s.

Economical parameters

Používání zdravé sadby je jedním z významných faktorů pro zvýšení produkce. Infekce pocházející z infikovaných sadbových hlíz (sekundární infekce) způsobuje nejvýznamnější snížení výnosů. Při napadení rostlin PVY dochází k 10 až 80% redukci výnosu hlíz, která může být zesílena v kombinaci s dalšími druhy virů. Při snížení výnosu konzumních brambor jenom o 10 % by vznikla zemědělským podnikům při současných průměrných cenách ekonomická ztráta 20–40 tis. Kč na hektar. Při snížení výnosu sadbových hlíz o 10 % vznikne ekonomická ztráta cca 20 tis. Kč na hektar. Vysoká infekce PVY vede dále k „sestupnění“ nebo zamítnutí sadbových materiálů, což znamená další významné ekonomické ztráty pro zemědělské podniky zaměřené na produkci sadby. Zdravý sadbový materiál patří k nejdůležitějším způsobům eliminace virů.

Certification body designation

ÚKZÚZ

Date of certification

—

Method of use

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů