Methodology for quantification of the fungal pathogen Rhizoctonia solani in soil using real-time PCR
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F24%3AN0000039" target="_blank" >RIV/60109807:_____/24:N0000039 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/62156489:43210/24:43924786
Result on the web
<a href="http://www.mendelu.cz" target="_blank" >http://www.mendelu.cz</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Metodika kvantifikace houbového patogenu Rhizoctonia solani v půdě metodou real-time PCR
Original language description
Cílem certifikované metodiky je optimalizovat molekulární metody detekce a kvantifikace polyfágního houbového patogenu Rhizoctonia solani z půdního prostředí. Metodika je zaměřena na hostitele lilek brambor, u kterého tento patogen způsobuje významné onemocnění – vločkovitost hlíz bramboru. Použitá metoda SybrGreen real-time PCR umožňuje vysokou citlivost detekce uvedeného patogenu v půdě a zajišťuje spolehlivost diagnostiky. Protokoly jsou optimalizovány pro běžné použití v laboratořích zabývajících se molekulární biologií.
Czech name
Metodika kvantifikace houbového patogenu Rhizoctonia solani v půdě metodou real-time PCR
Czech description
Cílem certifikované metodiky je optimalizovat molekulární metody detekce a kvantifikace polyfágního houbového patogenu Rhizoctonia solani z půdního prostředí. Metodika je zaměřena na hostitele lilek brambor, u kterého tento patogen způsobuje významné onemocnění – vločkovitost hlíz bramboru. Použitá metoda SybrGreen real-time PCR umožňuje vysokou citlivost detekce uvedeného patogenu v půdě a zajišťuje spolehlivost diagnostiky. Protokoly jsou optimalizovány pro běžné použití v laboratořích zabývajících se molekulární biologií.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK21010083" target="_blank" >QK21010083: Ecological protection of ware potatoes as a healthy vegetable against selected soilborne and seedborne pathogens</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2024
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
certifikovaná metodika
Regulation ID
UKZUZ 017154/2024
Technical parameters
Byla uzavřena smlouva o implementaci metodiky se společností Vesa Velhartice, a.s.
Economical parameters
Zavedení metodiky do laboratorní praxe (laboratoře přístrojově vybavené na molekulární metody) vyžaduje tyto náklady: Pro detekci R. solani je nezbytné pořízení speciálního přístroje – termocykleru pro real-time PCR (400–900 tis. Kč) Cena za extrakci DNA z jednoho vzorku půdy, myceliární kultury či rostlinného pletiva (referenční DNA) potřebné pro real-time PCR je 260 Kč (při doporučeném izolačním kitu). Vlastní náklady na detekci R. solani pomocí real-time PCR je 96 Kč (při doporučeném reakčním kitu). Cena jednoho kompletního testu (1 vzorek ve 3 technických opakováních; testovaný gen a referenční gen) se pohybuje kolem 360 Kč. Ceny jsou kalkulovány na základě nejlevnější nabídky spotřebního materiálu, nezahrnují režie a jsou bez DPH. Metoda Sybr Green real-time PCR je v současnosti levnější z důvodu absence sondy, kterou vyžaduje TaqMan real-time PCR.
Certification body designation
ÚKZÚZ
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů