RNA conformational classes

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F04%3A00100863" target="_blank" >RIV/61388963:_____/04:00100863 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

RNA conformational classes

Original language description

RNA exhibits a large diversity of conformations. Three thousand nucleotides of 23S and 5S ribosomal RNA from a structure of the large ribosomal subunit were analyzed in order to classify their conformations. Fourier averaging of the six 3D distributionsof torsin angles and analyses of the resulting pseudo electron maps, followed by clustering of the preferred combinations of torsion angles were performed on this dataset

Czech name

Konformační třídy RNA

Czech description

Tři tisíce nukleotidů ze struktury velké ribosomové jednotky, PDB ID 1JJ2, byly analyzovány a bylo ukázáno, že přes jejich extremní diversitu, nukleotidové konformace mohou být klasifikovány. Metodou Fourierovského průměrování a klastrováním bylo identifikováno 32 konformačních tříd, 18 z nich radikálně odlišných od A-RNA

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

CF - Physical chemistry and theoretical chemistry

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LN00A032" target="_blank" >LN00A032: Structure and dynamics of complex molecular systems and biomolecules</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Nucleic Acids Research

ISSN

0305-1048

e-ISSN

—

Volume of the periodical

32

Issue of the periodical within the volume

5

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

12

Pages from-to

1666-1677

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—