System for identification of mycobacterial promoters and determining their activity
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F25%3A00636145" target="_blank" >RIV/61388963:_____/25:00636145 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://doi.org/10.5281/zenodo.15119503" target="_blank" >https://doi.org/10.5281/zenodo.15119503</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Systém pro identifikaci mykobakteriálních promotorů a jejich aktivity
Original language description
Mykobakterie se vyznačují nestandardní strukturou operonových úseků DNA a regulací procesivity jejich transkripce (syntézy RNA). Připravený mykobakteriální plasmid obsahuje kódující sekvenci pro Bleo protein vázající zeocin, který zajišťuje bakteriální resistenci vůči tomuto antibiotiku. Před bleo kódující sekvencí se nacházejí unikátní restrikční místa vhodná pro vložení požadovaných úseků DNA za účelem průkazu jejich promotorové aktivity. Po transformaci bakterie Mycobacterium smegmatis mc²155 je příslušný bakteriální kmen testován na schopnost růstu na kultivačním médiu obsahující zeocin v koncentračním rozmezí 1–300 μg/mL. Lze taktéž využít diluční metodu pro určení minimální inhibiční koncentrace zeocinu, která je přímo úměrná promotorové aktivitě testovaného úseku DNA. Systém lze využít pro i pro DNA sekvence patogenních bakterií jako např. Mycobacterium tuberculosis.
Czech name
Systém pro identifikaci mykobakteriálních promotorů a jejich aktivity
Czech description
Mykobakterie se vyznačují nestandardní strukturou operonových úseků DNA a regulací procesivity jejich transkripce (syntézy RNA). Připravený mykobakteriální plasmid obsahuje kódující sekvenci pro Bleo protein vázající zeocin, který zajišťuje bakteriální resistenci vůči tomuto antibiotiku. Před bleo kódující sekvencí se nacházejí unikátní restrikční místa vhodná pro vložení požadovaných úseků DNA za účelem průkazu jejich promotorové aktivity. Po transformaci bakterie Mycobacterium smegmatis mc²155 je příslušný bakteriální kmen testován na schopnost růstu na kultivačním médiu obsahující zeocin v koncentračním rozmezí 1–300 μg/mL. Lze taktéž využít diluční metodu pro určení minimální inhibiční koncentrace zeocinu, která je přímo úměrná promotorové aktivitě testovaného úseku DNA. Systém lze využít pro i pro DNA sekvence patogenních bakterií jako např. Mycobacterium tuberculosis.
Classification
Type
G<sub>funk</sub> - Functional sample
CEP classification
—
OECD FORD branch
10606 - Microbiology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LX22NPO5103" target="_blank" >LX22NPO5103: National Institute of Virology and Bacteriology</a><br>
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2025
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
MycoProm&Act
Numerical identification
—
Technical parameters
Plasmidová DNA schopna replikace v druhu Mycobacterium smegmatis. DNA obsahuje Bleo resistenci, před níž se nachází restrikční místa pro tvorbu genomové knihovny. DNA je dodána ve formě roztoku.
Economical parameters
Systém umožňuje snadnou identifikaci klíčových promotorových sekvencí patogenních mykobakterií (např. M. tuberculosis, M. abscesus) v nízkonákladovém laboratorním režimu biologického rizika 1.
Application category by cost
—
Owner IČO
61388963
Owner name
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)
Licence fee requirement
—
Web page
https://doi.org/10.5281/zenodo.15119503