Flow cytometric and microscopic analysis of the effect of tannic acid on plant nuclei and estimation of DNA content

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F06%3A00081801" target="_blank" >RIV/61389030:_____/06:00081801 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Flow cytometric and microscopic analysis of the effect of tannic acid on plant nuclei and estimation of DNA content

Original language description

Flow cytometry (FCM) is extensively used to estimate DNA ploidy and genome size in plants. In order to determine nuclear DNA content, nuclei in suspension are stained by a DNA-specific fluorochrome and fluorescence emission is quantified. Recent studieshave shown that cytosolic compounds may interfere with binding of fluorochromes to DNA, leading to flawed data. Tannic acid, a common phenolic compound, may be responsible for some of the stoichiometric errors, especially in woody plants. In this study,the effect of tannic acid on estimation of nuclear DNA content was evaluated in Pisum sativum and Zea mays, which were chosen as model species. - Methods Nuclear suspensions were prepared from P. sativum leaf tissue using four different lysis buffers (Galbraith?s, LB01, Otto?s and Tris.MgCl2). The suspensions were treated with tannic acid (TA) at 13 different initial concentrations ranging from 0.25 to 3.50 mg mL-1. After propidium iodide (PI) staining, samples were analysed using FCM. I

Czech name

Cytometrická a mikroskopická analýza vlivu kyseliny taninové na buněčná jádra rostlin a měření obsahu DNA

Czech description

Průtoková cytometrie je metoda využívaná k určování ploidie a velikosti jaderného genomu. Pro zjišťování obsahu jaderné DNA jsou jádra v suspenzi barvena DNA-specifickým fluorochromem a fluorescence je kvantifikována. V této studii byl určován efekt kyseliny taninové při hodnocení obsahu jaderné DNA u Pisum sativum a Zea mays, které byly vybrány jako modelové druhy. Jaderná suspenze byla připravena z listové tkáně P. sativum s použitím čtyř různých lyzovacích pufrů (Galbraith?s, LB01, Otto?s and Tris.MgCl2). Suspenze byla ošetřena 13 koncentracemi kyseliny taninové (TA), od 0.25 do 3.50 mg mL-1. Po obarvení propidiem byly vzorky analyzovány pomocí FCM. TA ovlivnila fluorescenci PI a rozptylové vlastnosti světla jader rostlin, bez ohledu na použitý izolační pufr. Nejméně výrazný efekt TA byl pozorován u pufru Tris.MgCl2. Největší vliv na vzorky měly pufry Galbraith?s a LB01. Nově popsaný ´tannic acid effect´ se projevil ihned po ovlivnění. S výjimkou pufru Otto, jádra P. sativum a Z. ma

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LC06004" target="_blank" >LC06004: Integration of research activities to study the plant genome</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Annals of Botany

ISSN

0305-7364

e-ISSN

—

Volume of the periodical

98

Issue of the periodical within the volume

-

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

13

Pages from-to

515-527

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—