Rapid repair of DNA double strand breaks in Arabidopsis thaliana is dependent on proteins involved in chromosome structure maintenance
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F09%3A00321284" target="_blank" >RIV/61389030:_____/09:00321284 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Rapid repair of DNA double strand breaks in Arabidopsis thaliana is dependent on proteins involved in chromosome structure maintenance
Original language description
DNA double strand breaks (DSBs) are one of the most cytotoxic forms of DNA damage and must be repaired by recombination, predominantly via non-homologous joining of DNA ends (NHEJ) in higher eukaryotes. However, analysis of DSB repair kinetics of plant NHEJ mutants atlig4-4 and atku80 with the neutral comet assay shows that alternative DSB repair pathways are active. Surprisingly, these kinetic measurements show that DSB repair was faster in the NHEJ mutant lines than in wild-type Arabidopsis. Here we provide the first characterization of this KU-independent, rapid DSB repair pathway operating in Arabidopsis. The alternate pathway that rapidly removes the majority of DSBs present in nuclear DNA depends upon structural maintenance of chromosomes (SMC) complex proteins, namely MIM/AtRAD18 andAtRAD21.1.Anabsolute requirement for SMC proteins and kleisin for rapid repair of DSBs in Arabidopsis opens new insight into the mechanism of DSB removal in plants.
Czech name
Rychlá reparace dvojvláknových zlomů DNA je v Arabidopsis thaliana závislá na proteinech vystupujících při udržování struktury chromosomů
Czech description
Dvojvláknové zlomy DNA (DSBs) jsou nejtoxičtější formou poškození DNA, které musí být opraveno rekombinací, u vyšších eukaryot převážně nehomologním spojováním DNA konců (NHEJ). Nicméně analýza kinetiky reparace DSB rostlinných NHEJ mutant atlig4-4 a atku80 neutrální metodou komet ukázala přítomnost alternativní reparační dráhy DSB. Překvapivě tato kinetická měření ukázala, že reparace DSB v NHEJ mutovaných liniích je rychlejší než ve wild-type Arabidopsis. Uvádíme první charakterizaci této KU-nezávislédráhy rychlé reparace DNA funkční u Arabidopsis. Tato alternativní dráha, která rychle odstraňuje většinu DSBs přítomných v jaderné DNA závisí na komplexu proteinů udržujících strukturu chromosomů (SMC), jmenovitě MIM/AtRAD18 andAtRAD21.1. Naprostý požadavek SMCproteinů a kleisinů pro rychlou reparaci DSBs u Arabidopsis otvírá nový pohled na mechanismus eliminace DSB u rostlin.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2009
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Dna Repair
ISSN
1568-7864
e-ISSN
—
Volume of the periodical
8
Issue of the periodical within the volume
3
Country of publishing house
NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS
Number of pages
7
Pages from-to
—
UT code for WoS article
000263934300014
EID of the result in the Scopus database
—