DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F08%3AA0800PTK" target="_blank" >RIV/61988987:17310/08:A0800PTK - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/68081707:_____/08:00309774

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.

Original language description

Tumor suppressor protein p53 is one of the most important factors regulating cell proliferation, differentiation and programmed cell death in response to a variety of cellular stress signals. The p53 is a nuclear phosphoprotein, and its biochemical function is closely associated with the ability to bind DNA in a sequence-specific manner and operate as a transcription factor. Using a competition assay, we investigated the effect of the DNA topology on the DNA binding of human wild type p53 protein. At superhelix density higher than -??0.03, the relative effect of DNA supercoiling on the protein-DNA binding was similar for DNAs bearing both symmetrical and non-symmetrical target sites. On the other hand, at higher negative superhelix density the target sites with a perfect inverted repeat sequence exhibited a more significant enhancement of p53 binding due to increasing levels of negative DNA supercoiling.

Czech name

Topologie DNA ovlivňuje sekvenčně-specifickou vazbu proteinu p53 na DNA prostřednictvím strukturních přechodů cílových míst.

Czech description

Nádorový supresorový protein p53 patří mezi nejdůležitější faktory regulující buněčnou proliferaci, diferenciaci a programovou buněčnou smrt v odpovědi na rozličné buněčné stresové signály. Protein p53 je jaderný fosfoprotein a jeho biochemické funkce jsou těsně spjaty s jeho schopností vázat se sekvenčně-specificky na DNA a působit jako transkripční faktor. Použitím kompetičních technik jsme zkoumali vliv topologie DNA na vazbu standardního lidského proteinu p53 na DNA. Při superhelikální hustotě vyššínež -0,03 byl relativní efekt DNA-superhelicity na interakci mezi proteinem p53 a DNA podobný jak pro DNA obsahující symetrické tak i pro DNA s nesymetrickým vazebným místem. Při více negativních superhelikálních hustotách cílová místa s perfektně palindromatickými sekvencemi vykazovala významnější zvýšení vazby p53 než vazebná místa s porušenou palindromatickou symetrií.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Biochemical Journal

ISSN

—

e-ISSN

—

Volume of the periodical

412

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

7

Pages from-to

57-63

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—