Comparison of three template preparation methods for routine detection of beak and feather disease virus and avian polyomavirus with single and nested polymerase chain reaction in clinical specimens

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F08%3A00001845" target="_blank" >RIV/62157124:16170/08:00001845 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Comparison of three template preparation methods for routine detection of beak and feather disease virus and avian polyomavirus with single and nested polymerase chain reaction in clinical specimens

Original language description

Direct comparisons are important when assessing the value of DNA extraction methods for diagnostic virology as the inhibitors present and the efficiency of extraction vary with the target infectious agent as well as the species and the site from which the clinical sample was obtained. Three DNA extraction methods were compared for routine polymerase chain reaction (PCR) detection of beak and feather disease virus (BFDV) in whole blood and feather samples and of avian polyomavirus (APV) in feather samples. Boiling in Chelex 100 Resin was found to be the most sensitive method for detection of BFDV or APV DNA in both feather and blood samples. In combination with nested PCR it enabled detection of BFDV DNA in 13/13 positive whole blood samples and in 22/23 positive feather samples. It also enabled detection of APV in 31/31 samples detected as positive in this study. NucleoSpin kits enabled detection of BFDV DNA in only 9/13 blood samples and in 18/23 feather samples. The lower rate of BFD

Czech name

Porování tří metod přípravy teplátu pro rutinní detekci viru PBFD a aviárního polyomaviru pomocí jednoduché a nested PCR z klinických vzorků

Czech description

Přímé srovnání je důležité když hodnotíme význam DNA extrakčních metod pro diagnostikou virologii jak jsou inhibioty přítomné a účinnost extrace může být různá podle cílového infekčního agens stejně jako druhu a místa, ze kterého byl klinický vzorek získán . Tři DNA extrakční metody byly porovnány pro rutinní PCR detekci BFDV v plné krvi a ze vzorků peří a pro aviární polyomavirus (APV) ve vzorcích peří. Var v Chelexu 100 Resin byl zjištěn jako nejcitlivější metoda pro detekci BFDV nebo APV DNA jak ve vzorcích krve tak peří. V kombinaci s nested PCR to umožnilo detekci BFDV DNA u 13/13 pozitivní vzorků krve a v 22/23 pozitivní vzorcích peří. Také umožnilo tedtekci APV v 31/31 vzorků detekovaných jako pozitivní v této studii. NucleSpin kit umožnil detekci BFDV DNA pouze v 9/13 krevních vzorcích a v 18/23 vzorcích peří. Nižší frekvence BFDV DNA detekci při použití NucleoSpin kitu nebyla výsledkem inhibice PCR ve většině případů. NucleoSpin Tissue Kit umožnil detekci APV DNA v 29/31 vzork

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Avian Pathology

ISSN

0307-9457

e-ISSN

—

Volume of the periodical

37

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

5

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000260907600029

EID of the result in the Scopus database

—