Genomic analysis of E. coli from poultry revealed several important clonal lineages

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F21%3A43879291" target="_blank" >RIV/62157124:16170/21:43879291 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://vetweb.cz/" target="_blank" >https://vetweb.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Analýza genomu E. coli z drůbeže odhalila významné klonální linie

Original language description

Kolibacilóza drůbeže je komplexní onemocnění, zahrnující několik různých syndromů, které způsobují masivní ztráty u všech kategorií kura domácího na všech úrovních produkčního řetězce. Rozporuplné chápání původce tohoto onemocnění je hlavní překážkou v tvorbě efektivních preventivních opatření, které by zamezily jak ztrátám, tak spotřebě antibiotik. E. coli patogenní pro ptáky (APEC) je variabilním patotypem, jejž nelze definovat jediným charakteristickým znakem. Komparativní genomika s použitím celogenomového sekvenování ukazuje, že koncept APEC jako epidemicky se vyskytujících klonálních linií, přenášených produkčním řetězcem, může být výchozí bodem pro monitoring a diagnostické a intervenční strategie ke snížení prevalence těchto linií v chovech. První pokus uplatnit tento druh analýzy na izoláty z českých chovů odhalil hned několik potenciálně rizikových linií včetně sekvenčních typů ST117 a ST95.

Czech name

Analýza genomu E. coli z drůbeže odhalila významné klonální linie

Czech description

Kolibacilóza drůbeže je komplexní onemocnění, zahrnující několik různých syndromů, které způsobují masivní ztráty u všech kategorií kura domácího na všech úrovních produkčního řetězce. Rozporuplné chápání původce tohoto onemocnění je hlavní překážkou v tvorbě efektivních preventivních opatření, které by zamezily jak ztrátám, tak spotřebě antibiotik. E. coli patogenní pro ptáky (APEC) je variabilním patotypem, jejž nelze definovat jediným charakteristickým znakem. Komparativní genomika s použitím celogenomového sekvenování ukazuje, že koncept APEC jako epidemicky se vyskytujících klonálních linií, přenášených produkčním řetězcem, může být výchozí bodem pro monitoring a diagnostické a intervenční strategie ke snížení prevalence těchto linií v chovech. První pokus uplatnit tento druh analýzy na izoláty z českých chovů odhalil hned několik potenciálně rizikových linií včetně sekvenčních typů ST117 a ST95.

Type

J_ost - Miscellaneous article in a specialist periodical

CEP classification

—

OECD FORD branch

40301 - Veterinary science

Project

<a href="/en/project/QK1810462" target="_blank" >QK1810462: Manipulation of the intestinal microbiota of pigs and poultry to reduce E. coli infections and use of antimicrobials</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2021

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Veterinářství

ISSN

0506-8231

e-ISSN

—

Volume of the periodical

71

Issue of the periodical within the volume

4

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

5

Pages from-to

201-205

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—