9fitch: a program to do phylogenetic analysis by Fitch's method
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985831%3A_____%2F07%3A00087844" target="_blank" >RIV/67985831:_____/07:00087844 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
9fitch: a program to do phylogenetic analysis by Fitch's method
Original language description
Inspired by a program by J. Felsenstein, 9fitch is a program to carry out Fitch-Margoliash, Least Squares, and a number of similar methods for deducing phylogeny from distance matrix. In analyzing these data, distance matrix programs implicitly assume that: Each distance is measured independently from the others: no item of data contributes to more than one distance. The distance between each pair of taxa is drawn from a distribution with an expectation which is the sum of values (in effect amounts of evolution) along the tree from one tip to the other. The variance of the distribution is proportional to a power p of the expectation. The program is written to run natively under the Plan 9 OS.
Czech name
9fitch: program pro fylogenetickou analýzu pomocí Fitch-Margoliashovy metody
Czech description
9fitch je fylogenetický program inspirovaný programe m J Felsensteina. Odvozuje fylogenetický strom pomocí metody Fitch-Margoliashe, metodou nejmenších čtverců a několiks jinými podobnými metodami. Fylogenezi odvozuje z distanční matice. Předpokládá nezávislost dat v tom smyslu, že žádná položka nepřispívá do vzdálenostní matice více než jednou. Vzdálenost mezi dvěma taxony je vzorkována z rozdělení, jehož střední hodnota je suma evolučních vzdáleností podél fylogenetického stromu z jednoho listu do druhého. Rozptyl rozdělení je úměrný tzv. ?síle očekávání?. program je napsán tak, aby běžel v nativním módu pod distribuovaným operačním systémem Plan 9, který má v budoucnosti nahradit UNIX.
Classification
Type
X - Unclassified
CEP classification
EG - Zoology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA205%2F03%2F1124" target="_blank" >GA205/03/1124: Biochronology and taxonomy of the Middle Devonian polycystine Radiolaria of the Barrandian</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů