A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F06%3A00038936" target="_blank" >RIV/68081707:_____/06:00038936 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216275:25310/06:00004082

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion

Original language description

Molecular diagnostics of inherited neurodegenerative disorders such as Friedreich ataxia (FRDA) is based on analysis of the length of trinucleotide repetitive sequences in genomic DNA. Length of a triplet repetitive DNA sequence can be determined using asingle-surface technique involving multiple hybridization of the expanded triplet repeat with short labeled reporter probe. Target DNA (tDNA) is adsorbed onto surface of a carbon electrode. Biotin-labeled reporter probe is hybridized with the immobilized tDNA followed by binding of streptavidinalkaline phosphatase (ALP) conjugate. The ALP catalyzes production of an electroactive indicator (1-naphthol) which is detected voltammetrically on the same electrode. Detection of (GAA)n . (TTC)n triplet repeatexpansion in nanogram quantities of PCR-amplified tDNAs, including amplicons of patients genomic DNA, is demonstrated.

Czech name

Jednopovrchový elektrochemický biosenzor pro detekci expanze trinukleotidových opakování

Czech description

Molekulární diagnostika dědičných neurodegenerativních onemocnění jako je Friedreichova ataxie (FRDA) je založena na analýze délky trinukleotidových opakujících se sekvencí genomové DNA. Délka těchto sekvencí může být detekována pomocí jednopovrchové techniky zahrnující několikanásobnou hybridizaci expandovaných trinukleotidových opakování s krátkou značenou sondou. Cílová DNA (tDNA) je adsorbována ne povrch uhlíkové elektrody. Sonda značená biotinem je hybridizována s imobilizovanou tDNA, poté následuje vazba konjugátu streptavidinu s alkalickou fosfatázou (ALP). ALP katalyzuje vznik elektroaktivního indikátoru (1-naftol), který je detekován voltametricky na stejné elektrodě. Zde je ukázána detekce expanze trinukleotidových opakování (GAA)n . (TTC)n vPCR-amplifikovaných tDNA, včetně aplikonů genomové DNA pacientů. Pomocí této techniky jsme schopni rozlišit normální a patologické alely genu X25, které souvisí s FRDA.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Electroanalysis

ISSN

1040-0397

e-ISSN

—

Volume of the periodical

18

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

11

Pages from-to

141-151

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—