Ethanol is a better inducer of DNA guanine tetraplexes than potassium cations

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F06%3A00039039" target="_blank" >RIV/68081707:_____/06:00039039 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Ethanol is a better inducer of DNA guanine tetraplexes than potassium cations

Original language description

Here we show using CD spectroscopy that ethanol induces the guanine tetraplexes like or even better than potassium cations. We present examples of ethanol stabilizing guanine tetraplexes even in cases when potassium cations fail to do so. Hence, besidesthe A-form or Z-form, ethanol stabilizes another conformation of DNA, i.e., the guanine tetraplexes. We discuss mechanism of the stabilization. Use of ethanol will permit studies of guanine tetraplexes that cannot be induced by potassium cations or othertetraplex-promoting agents. This work demonstrates that a still broader spectrum of nucleotide sequences can fold into guanine tetraplexes than has previously been thought. Aqueous ethanol may better simulate conditions existing in vivo than the aqueoussolutions.

Czech name

Etanol indukuje guaninové DNA tetraplexy lépe než draselné kationty

Czech description

Na základě CD spektroskopie ukazujeme, že etanol indukuje guaninové tetraplexy stejně nebo dokonce lépe než draselné kationty. Uvádíme příklady guaninových tetraplexů stabilizovaných etanolem v případech, kdy draselné kationty tetraplex nestabilizují. Etanol tedy mimo formu A- a Z-DNA stabilizuje další uspořádání - guaninové tetraplexy. Diskutujeme mechanismus jejich stabilizace. Tato práce ukazuje, že spektrum nukleotidových sekvencí, které mohou tvořit guaninové tetraplexy, je širší než se původně předpokládalo. Navíc vodný roztok etanolu pravděpodobně simuluje lépe podmínky in vivo než vodné roztoky.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA4004201" target="_blank" >IAA4004201: Tetraplexes of DNA and Their Occurrence in the Human Genome</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Biopolymers

ISSN

0006-3525

e-ISSN

—

Volume of the periodical

82

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

8

Pages from-to

253-260

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—