Preferential integration of human immunodeficiency virus type 1 into genes, cytogenetic R bands and GC-rich DNA regions: insight from the human genome sequence

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F02%3A00108998" target="_blank" >RIV/68378050:_____/02:00108998 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/68378050:_____/02:00191515
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
Preferential integration of human immunodeficiency virus type 1 into genes, cytogenetic R bands and GC-rich DNA regions: insight from the human genome sequence
Original language description
After entering a cell during infection, the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) undergoes a series of steps including reverse transcription of its genome and culminating in integration of proviral DNA into the host chromosomes. We used the BLAT program to map the genomic positions of integration sites in the most recent GoldenPath assembly. It appears that HIV-1 preferably integrates into genes, genome regions with increased gene density, cytogenetic light bands and GC-rich regions
Czech name
Preferenční integrace viru lidské imunodeficience typu 1 do genů, cytogenetických pruhů R a DNA oblastí bohatých na GC: informace ze sekvence lidského genomu
Czech description
Po vstupu do buňky při infekci dochází ve viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1) k sérii kroků zahrnujících reverzní transkripci jeho genomu a vrcholících v integraci provirové DNA do hostitelských chromozomů. Využili jsme program BLAT k mapování genomových pozicí integračních míst v nejnovější kolekci GoldenPath. HIV-1 zřejmě preferenčně integruje do genů, genomových oblastí se zvýšenou hustotou genů, cytogenetických světlých pruhů a oblastí bohatých na GC

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year
2002
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)