Mouse consomic strains: Exploiting genetic divergence between Mus m. musculus and Mus m. domesticus subspecies
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F08%3A00306624" target="_blank" >RIV/68378050:_____/08:00306624 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Mouse consomic strains: Exploiting genetic divergence between Mus m. musculus and Mus m. domesticus subspecies
Original language description
Consomic (chromosome substitution) strains (CSs) represent the most recent addition to the mouse genetic resources aimed to geneticaly analyze complex trait loci (QTLs). In this study, we report the development of a set of 28 mouse inter-subspecific CSs.In each CS, we replaced a single chromosome of the C57BL/6J (B6) inbred strain (mostly Mus m. domesticus) with its homolog from the PWD/Ph inbred strain of the Mus m. musculus subspecies. These two progenitor subspecies diverged less than 1 million years ago and accumulated a large number of genetic differences that constitute a rich resource of genetic variation for QTL analyses. A genome-wide scan of 965 DNA markers revealed 99.87% purity of the B6 genetic background. Thirty-three nonsynonymous substitutions were uncovered in the protein-coding regions of the mitochondrial DNA of the B6.PWD-mt conplastic strain. A pilot phenotyping experiment project revealed a high number of variations among B6.PWD consomics.
Czech name
Myší konsomické kmeny: Využití genetické rozdílnosti mezi poddruhy Mus m. musculus a Mus m. domesticus
Czech description
Konsomické (chromosomální substituční) kmeny (CS) představují nejnovější nástroj myší genetiky určený pro genetickou analýzu komplexních znaků (QTL). V této práci oznamujeme přípravu souboru 28 myších mezipoddruhových CS. V každém CS jsme nahradili jedenchromozom B6 inbredního kmene (převážně Mus m. domesticus) jeho homologem z PWD/Ph inbredního kmene poddruhu Mus m. musculus. Tito progenitoři se oddělili zhruba před 1 milionem let a nahromadili velký počet genetických rozdílů, představujících bohatý zdroj genetické variace pro QTL analýzy. Celogenomový sken 965 DNA markerů prokázal 99.87% čistotu genetického pozadí. 33 nesynonymních substitucí bylo nalezeno v protein kodujících oblastech mitochrondriální DNA B6.PWD-mt konplastického kmene. Pilotní fenotypizační pokus odhalil velký počet variant mezi B6.PWD konsomiky.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Genome Research
ISSN
1088-9051
e-ISSN
—
Volume of the periodical
18
Issue of the periodical within the volume
3
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
7
Pages from-to
—
UT code for WoS article
000253766700017
EID of the result in the Scopus database
—