Semantic Biclustering Analysis of Gene Expression Data
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F16%3A00300014" target="_blank" >RIV/68407700:21230/16:00300014 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.enbik.cz/enbik2016/abs/u147_p34_s1_L.doc" target="_blank" >http://www.enbik.cz/enbik2016/abs/u147_p34_s1_L.doc</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Sémantická dvojshluková analýza dat genové exprese
Original language description
Dvojshluková analýza dat genové exprese je používaná bioinformatická metoda pro vyhledávání význačných lokálních vzorů v genové matici. Matice genových expresí je uvedenou metodou analyzována, na rozdíl od klasických jednodimenzionálních shlukovacích metod, současně ve dvou dimenzích: v dimenzi obsahující geny (řádky) a v dimenzi obsahující jednotlivé vzorky (sloupce). Algoritmus pro dvojshlukování tedy identifikuje podskupiny genů v podskupině vzorků. Typickým příkladem sémantického shlukování při analýze genových dat je shlukování genů na základě hodnoty exprese, kde jednotlivé shluky mohou být charakterizovány pomocí termů z Gene ontology.
Czech name
Sémantická dvojshluková analýza dat genové exprese
Czech description
Dvojshluková analýza dat genové exprese je používaná bioinformatická metoda pro vyhledávání význačných lokálních vzorů v genové matici. Matice genových expresí je uvedenou metodou analyzována, na rozdíl od klasických jednodimenzionálních shlukovacích metod, současně ve dvou dimenzích: v dimenzi obsahující geny (řádky) a v dimenzi obsahující jednotlivé vzorky (sloupce). Algoritmus pro dvojshlukování tedy identifikuje podskupiny genů v podskupině vzorků. Typickým příkladem sémantického shlukování při analýze genových dat je shlukování genů na základě hodnoty exprese, kde jednotlivé shluky mohou být charakterizovány pomocí termů z Gene ontology.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
JC - Computer hardware and software
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA14-21421S" target="_blank" >GA14-21421S: Automatic analysis of spatial gene expression patterns</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2016
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů