Cílená degradace proteinů v odpovědi na rostlinný hormon cytokinin

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Šestý rámcový program Evropského společenství pro výzkum, technický rozvoj a demonstrační činnosti

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

MSMT-539/2017-1

Název projektu anglicky

Targeted protein degradation in plant hormone cytokinin responses

Anotace anglicky

(1) Generation of new mutant lines. The CRISPR/Cas9 system for targeted mutagenesis shall be used to generate mutants in genes of ubiquitylation components. Primary goal is to generate mutants in genes AtUBC7, 15, 17, 22, 34, 37 and KMD3 for which no T-DNA insertion allele is available. Depending on the ease of progress, focus will either be put on the four most promising candidates (AtUBC15, 17, 22, 37), or all these genes will be addressed. (2) Stacking of mutants by crossing and, in order to obtain closely related double mutants, CRISPR/Cas9 activity in single mutant backgrounds. (3) Physiological analysis of the available and newly obtained mutants. The analysis shall include a “gauntlet” of assays to also test relations to pathways other than cytokinin and will be complemented by transformation of WT gene copies into the mutants in order to obtain lines for comparison. (4) (4) Proteome-wide analysis of the effects of disturbance in proteasome-dependent signaling on proteome level. Robust discovery proteomics will be used to thoroughly analyze (i) available and newly generated mutants in ubiquitinylation pathway and (ii) available lines with disrupted proteasome or cytokinin homeostasis. We will focus our work on seed germination and an early seedling development. During the imbibition, protein turn-over and hormonal signaling are clearly important. By disrupting the ubiquitin-proteasome cascade and/or manipulating cytokinin signaling, the degradation targets will accumulate and we will be able to identify them. The second part, the analysis of proteasome-cytokinin interaction in seedlings, will allow to capitalize on our previous results and we will employ targeted proteomics to monitor changes in abundance of identified cytokinin-responsive proteins.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl realizován v rámci Aktivity MOBILITY, jejímž hlavním cílem je navázání a prohlubování kontaktů se zahraničními výzkumnými institucemi. Neprobíhá tedy kontrola dílčích výstupů projektu prostřednictvím hodnotící komise, avšak je kontrolována správnost čerpání přidělených financí a přiměřenost jejich využití.

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 2. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-MSM-7A-U/01:1

Datum dodání záznamu

18. 6. 2019

Celkové uznané náklady

175 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

175 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč