NMR povrchových proteinů evropských borrelií

Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
Podpora mobility výzkumných pracovníků a pracovnic v rámci mezinárodní spolupráce ve VaVaI
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
M2 - Mezinárodní spolupráce
Číslo smlouvy
MSMT-15490/2019-2

Název projektu anglicky
NMR of European borrelia surface proteins
Anotace anglicky
Species-to-species variations in the structures and binding epitopes will be investigated by solution NMR spectroscopy of recombinant proteins accompanied by other biochemical and biophysical methods. Isotopic labelling and specific point mutations will be used to assign the NMR resonances sequence specifically. Chemical shift perturbation (CSP) titration experiments will identify binding epitopes. Secondary structure estimation is possible in early stages based on NMR chemical shifts, establishing if the proteins are well folded and share similarity with previously investigated. Dbps from other borrelia strains/species. NMR methodology is particularly suitable as it allows one to locate interaction sites even in regions of proteins, which are intrinsically disordered. In summary, key objectives, which are directly related to the project tasks, in the project timeline are: 1. Overexpression of the recombinant proteins in E. coli. 2. Introduction of NMR-active stable isotopes (15N, 13C) by uniform enrichment from labelled culture media 3. Multi-dimensional triple resonance NMR experiments for resonance assignment 4. Residue-specific estimation of secondary structure type content 5. Three-dimensional structure determination 6. Interaction studies with GAGs by NMR titration

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt byl realizován v rámci Aktivity MOBILITY, jejímž hlavním cílem je navázání a prohlubování kontaktů se zahraničními výzkumnými institucemi. Neprobíhá tedy kontrola dílčích výstupů projektu prostřednictvím hodnotící komise, avšak je kontrolována správnost čerpání přidělených financí a přiměřenost jejich využití.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MSM-8J-U
Datum dodání záznamu
30. 6. 2023

Podobné projekty(10)