Odhalení komponent nehostitelské rezistence Arabidopsis thaliana a Brassica carinata k Leptosphaeria spp. pomocí celogenomové asociační studie

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Podpora mobility výzkumných pracovníků a pracovnic v rámci mezinárodní spolupráce ve VaVaI

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

MSMT-18714/2022-81

Název projektu anglicky

Phoma stem canker, nonhost resistance, Arabidopsis thaliana, Brassica carinata, Leptosphaeria maculans, Leptosphaeria biglobosa

Anotace anglicky

The Leptosphaeria species complex encompasses fungi pathogenic to oilseed rape (Brassica napus). Within this species complex, L. maculans is the causal agent of stem canker disease of B. napus. Its high adaptive capacities make breeding for specific resistance a challenge, which underlines the need to understanding non-specific quantitative resistance, regarded as a more durable source of resistance. L. maculans and L. biglobosa are non-adapted to A. thaliana Col-0 and L. maculans fails to infect B. carinata; A. thaliana and B. carinata are thus considered non-host of L. maculans. The main aim of this project is to find out common and distinct components involved in A. thaliana and B. carinata non-host resistance to L. maculans and/or L. biglobosa. We intend to reveal components underlying resistance/susceptibility using a set of A. thaliana ecotypes (187) (1001 Genomes Consortium, 2016). This project will benefit from another project developed by one of the collaborators (INRAE BIOGER) aiming at understanding non-host resistance (NHR) in B. carinata. Inoculation of the ecotypes by Leptosphaeria spp. will result in formation of ecotype groups characterized by specific plant-pathogen interactions from nonhost to susceptible response. The selected ecotypes will be characterized and the gene loci related to distinct phenotype groups identified. Gene expression profiles of the candidate genes in B. napus and B. carinata infected by L. maculans and/or L. biglobosa will enable to identify the resistance or susceptibility determinants of both host plants. Deciphering non-host interactions between A. thaliana and B. carinata towards L. maculans and / or L. biglobosa will serve as a ground for elucidation of key determinants of NHR in other Brassicaceae species and represent valuable data for breeders.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - další vedlejší obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EF - Botanika

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl realizován v rámci Aktivity MOBILITY, jejímž hlavním cílem je navázání a prohlubování kontaktů se zahraničními výzkumnými institucemi. Neprobíhá tedy kontrola dílčích výstupů projektu prostřednictvím hodnotící komise, avšak je kontrolována správnost čerpání přidělených financí a přiměřenost jejich využití.

Zahájení řešení

1. 1. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2024

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

10. 2. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-MSM-8J-U

Datum dodání záznamu

27. 6. 2025

Celkové uznané náklady

156 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

156 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč