Porovnání metod izolace bakteriálních extracelulárních vezikul pro studium jejich interakce s hostitelskými buňkami

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Podpora mobility výzkumných pracovníků a pracovnic v rámci mezinárodní spolupráce ve VaVaI

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

-

Název projektu anglicky

Comparison of methods for isolating bacterial extracellular vesicles to study their interaction with host cells

Anotace anglicky

We hypothesize that the method used to isolate BEVs from culture media affects the composition of BEVs, which in turn may influence their interaction with eukaryotic target cells. In this project, we will isolate EcO83-OMVs (representing Gram–negative bacteria) and Ef-EVs (representing Gram–positive bacteria) using two different methods. We will characterize their biophysical properties, composition, and effect on eukaryotic cells. Aim 1: Cultivation of E. coli O83 and E. faecium CCM7167T. Isolation and purification of vesicles by SEC or sucrose cushion ultracentrifugation. Aim 2. Characterisation of EcO83-OMVs and Ef-EVs: concentration, particle size, polydispersity index (PDI), zeta potential (ζ), presence of LPS and LTA, and proteomics. Aim 3. Characterisation of specific pathway of uptake of EcO83-OMVs and Ef-EVs in eukaryotic cells. Aim 4. Localisation of EcO83-OMVs and Ef-EVs in dendritic cells (DC) and in co-culture of Caco-2/HT29-MTX, and their effect on DC phenotype.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30102 - Immunology

OECD FORD - vedlejší obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EC - Imunologie<br>EE - Mikrobiologie, virologie

Zahájení řešení

1. 1. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MSM-8J-R

Datum dodání záznamu

29. 1. 2024

Celkové uznané náklady

192 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

192 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč