Strukturní charakterizace NuA4 s nehistonovým acetylačním cílem

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Podpora mobility výzkumných pracovníků a pracovnic v rámci mezinárodní spolupráce ve VaVaI

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

MSMT-4361/2024-5

Název projektu anglicky

Structural characterization of NuA4 with a nonhistone acetylation target

Anotace anglicky

In recent years, several partial or complete structures of NuA4 have been published, including a structure with a bound nucleosome - the natural substrate of this multiprotein complex. NuA4 also plays a role in many other cellular processes, but the mechanism of any other interaction is not yet known. The subject of the present project is precisely to study these interactions and to try to establish whether the surface for binding other proteins to acetylate is the same or partially different and what is the mechanism of their recognition. The collaboration is based on the mutual transfer of experience between the French and Czech teams. In total, the project is divided into five sub-objectives, with the first one to be carried out at the IOCB, the second one at the IGBMC, the third one in parallel at both sites and the fourth and fifth ones at the IGBMC. The sub-objectives of the project are: 1) optimization of the recombinant preparation of a non-histone acetylation target, 2) isolation of the endogenous NuA4 enzyme complex, 3) verification of enzymatic activity by acetylation assay, 4) preparation of a sample of bound NuA4 with acetylation target for Cryo-EM, 5) determination of the three-dimensional structure by Cryo-EM and definition of key cues for distinguishing different targets of enzymatic activity. In the framework of the present project, we aim to fully develop the collaboration with renowned experts from the Integrative Structural Biology Unit at the IGBMC in France and to support the development of scientific careers of young scientists from both collaborating countries. The transfer of scientific expertise and the involvement of PhD students is an integral part of this project. The Czech team is very proficient in the preparation of recombinant proteins, including their rapid and accurate biophysical characterisation by NMR. The French team includes experts in endogenous sample handling and three-dimensional structure determination using Cryo-EM.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-MSM-8J-R

Datum dodání záznamu

11. 2. 2025

Celkové uznané náklady

157 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

157 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč