Námel: alkaloidy, populační diverzita a evoluce

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-00788S

Název projektu anglicky

Ergot: alkaloids, population diversity, and evolution

Anotace anglicky

The aim of the project is revision of established species of Claviceps and description of new ones based on morphology and DNA sequences together with dated reconstruction of the genus evolution. Cryptic species within C. purpurea, differing in habitat preferences, will be delimited. Population diversity inside the cryptic species will be studied related to host preferences and alkaloid chemotypes. Gene flow and recombination among the putative host-specific and geographic subpopulations will be assessed. Isolates will be characterized using microsatellites, sequences of active sites of nonribosomal peptide synthetases and alkaloids found in the sclerotia. Set of isolates will be collected on Czech natural locations that enable coexistence of different subpopulations (cereals-grass, humidity gradient). Another set will consist of C. purpurea isolates collected worldwide. Evolutionary history of the genus Claviceps based on multilocus analysis will be reconstructed from five genes and more than 30 species and calibrated on a related fossil and mutation rates known from other fungi.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EH - Ekologie – společenstva

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt významně přispěl k poznání taxonomie, fylogeneze a genetické struktury populací druhů rodu Claviceps v geografickém kontextu. Celkově přinesl pět publikací, tři z nich jsou publikované v renomovaných vědeckých časopisech.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

5. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

5 435 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 435 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč