Profilování genové exprese a funkční charakterizace subpopulací gliových buněk po ischemickém poškození mozku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-02154S

Název projektu anglicky

Gene expression profiling and functional characterization of glial cell subpopulations following ischemic brain injury

Anotace anglicky

Astrocytes and NG2-glia subpopulations display striking physiological/functional heterogeneity, which is reflected by marked differences in their gene expression profiles and their responses to CNS injury or disease. An exceedingly powerful high throughput platform will be employed to classify astrocytic and NG2-glia subpopulations based on single cell gene expression profiling followed by their functional characterization. We aim to clarify their role in the dynamics of postnatal brain development and following cerebral ischemia using transgenic mice in which different astrocyte/NG2-glia subtypes can be visualized. Using advanced multivariate and multiway modeling, we aim to construct a dynamic model of brain development and regeneration following ischemia with resolution down to the single cell. The single cell expression profiling platform combined with the data mining and modeling approaches of multiway data will thus provide a powerful approach to identify important and novel expression pathways for the future development of glia-oriented therapeutic strategies.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30103 - Neurosciences (including psychophysiology)<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>30210 - Clinical neurology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly identifikovány a charakterizovány iontové kanály hrající významnou roli v postischemické CNS a které tak mohou sloužit jako cíle v terapii zaměřené na gliové buňky. Metodicky byly vyvíjeny nové nástroje a přístupy k analýze exprese na úrovni jednotlivých buněk pomocí RTqPCR a umožňující korelaci výsledků. Výsledky jsou shrnuty v 8 publikacích Jimp a 2 Jsc.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

6. 5. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

10 720 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 720 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč