Genomická architektura a molekulární podstata hybridní sterility myši.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-08078S

Název projektu anglicky

Genomic architecture and molecular basis of hybrid sterility of the mouse.

Anotace anglicky

Hybrid sterility (HS) is a universal phenomenon associated with speciation in such diverse organisms as yeast, plants, insects, birds or mammals. Much progress has been made in the last ten years in genetic analysis of HS including our discovery of Prdm9, the first HS gene in vertebrates. However, neither exact number of HS genes nor their interactions have been elucidated in any species. In this project we will apply the current tools of mouse genomics and bioinformatics to understand genetic architecture of hybrid sterility and to uncover gene networks involved in intrameiotic arrest of hybrids between two forms of mouse, Mus musculus. We will identify HS genes by QTL mapping, deconstruct multigenic networks using our unique set of chromosome substitution strains, and apply RNA-seq profiling, BAC transgenesis, and gene knockouts to verify the candidate genes. To stay at the cutting edge in genetics of reproduction and speciation we will analyze genes controlling DNA double-strand breaks and meiotic recombination in relation to the defects in meiotic chromosome synapsis and HS.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Jednalo se o projekt hledání souvislostí mezi hybridní sterilitou samců a meiotických mechanizmů u hybridů příbuzných myších poddruhů. Byl studován lokus Hstx2 kontrolující společně s Prdm9 tento fenomén pomocí řady rozvinutých technologií na úrovni genomu. Významným příspěvkem je potvrzení role nekodujících úseků DNA ve zmíněných procesech.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

12 313 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

12 313 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč