Počítačové modelování interakcí organické hmoty a biomolekul s minerálními povrchy

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Hlavní účastníci
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
13-08651S

Název projektu anglicky
Computational study of interactions of organic matter and biomolecules with mineral surfaces
Anotace anglicky
The project is focused on computer modeling of interactions of organic molecules (natural organic matter, polycyclic aromatic hydrocarbons), biomolecules (DNA building blocks) and binary mixtures of solvents with mineral surfaces applied on environmentally and technologically important systems. Interactions of these molecules with quartz and rutile surfaces will be studied for a set of surface charge densities corresponding to the experimentally or naturally relevant ranges of pH values employing molecular mechanics, molecular dynamics and ab initio techniques. The simulation outputs will provide conformations of the adsorption complexes, thermodynamic properties, i.e. interaction energies, free energies and adsorption isotherms. Leading interactions and roles of participating atoms and groups will be identified in the complexes. Our simulation results will be linked with experimental results, both using existing experimental data as well as carrying out simulations related to ongoing experimental research of our partners.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10403 - Physical chemistry

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Tento relativně malý čtyřletý projekt přinesl řadu výsledků v oblasti modelování povrchů i v metodologii. Závěrečná zpráva je pečlivě zpracována. Výběr témat má environmentální motivaci, přímé aplikace se však nečekají. Kladně lze hodnotit zapojení studentů. Publikováno bylo 11 článků v kvalitních časopisech. Celkově lze výstupy hodnotit jako solidní a kvalitní vědu.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017

Podobné projekty(10)