Výzkum struktury proteinů prostřednictvím polarizační fluorescenční mikroskopie

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Centrum výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-10799S

Název projektu anglicky

Insights into protein structure from polarization fluorescence microscopy

Anotace anglicky

Optical properties of fluorescent proteins (FPs) are anisotropic. This fact can be used to develop a broad range of genetically encoded probes of biological processes. In principle, FP anisotropy (through polarization microscopy) can also provide information about protein structure, in living cells. This possibility, however, remains unexplored. We want to fill this gap by testing the hypothesis that polarization microscopy can be used to determine the orientation of an FP with respect to other parts of a fusion protein. In order to achieve this goal, we will: 1) determine orientation of transition dipole moments (TDMs) with respect to the cell membrane in FP-labeled membrane proteins; 2) determine TDM direction in molecules of representative FPs; and 3) determine orientation of the FP moiety in several membrane protein constructs and compare the results with available structural data. The results will provide fundamental information about FPs, allow improvements in genetically encoded fluorescent probes, and yield new tools for obtaining protein structure information.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

ED - Fyziologie

CEP - další vedlejší obor

CE - Biochemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30105 - Physiology (including cytology)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl zaměřen na rozvoj techniky polarizační fluorescenční mikroskopie a rozšíření její uplatnění. V průběhu projektu bylo dosaženo splnění převážné většiny deklarovaných cílů. Výsledky byly publikovány v 5 impaktovaných časopisech. Řešení projektu vedlo k udělení patentu v EU. Finanční prostředky čerpány ve schválené struktuře, přesuny byly zdůvodněné.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

23. 4. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/05:1

Datum dodání záznamu

25. 6. 2019

Celkové uznané náklady

7 182 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 182 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč