3-Nitro-L-tyrosin ve strukturách neurodegenerativních proteinů
Cíle projektu
Vliv oxidativního stresu na strukturu neurodegenerativních proteinů bude studován na chemických modelech s využitím kombinace chiroptických spektroskopií a teoretických výpočtů spekter. Jeden z důsledků oxidativního stresu je modifikace tyrosinu na 3-nitro-L-tyrosin v proteinech. Tato modifikace výrazně mění hydrofobní a acidobazický charakter aminokyselinového zbytku. Ovlivní-li modifikace sekundární strukturu, může ovlivnit i propuknutí neurodegenerativních onemocnění, která jsou způsobena změnami konformace proteinů. Vybranými molekulami pro studium konformačních změn jsou modely odvozené od prionového proteinu a alfa-synukleinu. První z nich se uplatňuje při transmisivní spongiformní encefalopatii a druhý při Parkinsonově nemoci. Získaná spektroskopická data budou korelována se schopností nitrovaných proteinů agregovat a tvořit amyloidní fibrily. Pro látky s nízkou rozpustností (amyloidní proteiny) se pro spektroskopické experimenty využijí techniky pro amplifikaci signálu založené na povrchově zesílených jevech na stříbrných a zlatých nanočásticích.
Klíčová slova
3-nitrotyrosinealpha-synucleinprion proteinRaman spectroscopyRaman optical activity
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Hlavní účastníci
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
14-00431S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
3-Nitro-L-tyrosine in structures of neurodegenerative proteins
Anotace anglicky
The influence of oxidative stress in protein metabolism on the structure of neurodegenerative proteins will be investigated on chemical models by chiroptical spectroscopies combined with theoretical calculations of spectra. One of the results of oxidative stress is modification of tyrosine to 3-nitro-L-tyrosine in proteins. This modification changes significantly the hydrophobicity and acidity of the residue. Since the secondary structure of mutated proteins could be altered, the modification could influence the onset of the neurodegenerative diseases caused by changes of the protein conformation. Selected targets for such conformational changes will be the prion protein and alpha-synuclein models. The first one plays role in transmissible spongiform encephalopathies and the second one in Parkinson's disease. The spectroscopic data will be correlated with the ability of nitrated protein to aggregate and to form amyloidogenic fibrils. The spectroscopic measurements of sparingly soluble amyloidogenic proteins will use signal enhancement on the surface of silver and gold nanoparticles.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10403 - Physical chemistry
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Přínosem projektu je prokázání změn reaktivity a lipofilního charakteru studovaných modelů neurodegenerativních proteinů vlivem nitrace tyrosinu, a vypracování metodiky pro měření Ramanových spekter nitrovaných proteinů založené na zesílení signálu na stříbrných nanočásticích umožňující určení míry tyrosinové nitrace derivátů alfa-synukleinu. Byly publikovány 4 práce v impaktovaných časopisech
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2014
Ukončení řešení
31. 12. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
5. 4. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
4 344 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 344 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 344 tis. Kč
Statní podpora
4 344 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Doba řešení
01. 01. 2014 - 31. 12. 2016