Evoluce, diversifikace a biogeografie polyploidní čeledi Zingiberaceae: synergie fylogenomiky, cytogenomiky, geologické a klimatické historie
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
14-13541S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Evolution, diversification and biogeography of polyploid Zingiberaceae: synergy of phylogenomics, cytogenomics, geological and climate history
Anotace anglicky
Ginger family (Zingiberaceae) is economically important tropical family with ca. 50 genera mainly in Southeast Asia and partly in Africa and South America. We apply state-of-the-art next generation sequencing phylogenomic techniques (hybridization-based enrichment and genome skimming) to obtain sequences of whole chloroplasts and several hundreds of nuclear genes for hundreds of species. This allows building a robust and well-resolved phylogeny of the family. Phylogeny will be properly calibrated using the fossil records. Number of polyploidization events that happened throughout the evolution of the Zingiberaceae will be estimated using genomic and cytogenetic information and set them into the time scale. Finally, calibrated phylogeny will be used for reconstruction of historical biogeographic patterns of ginger family.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt zaměřený na komplexní vztahy uvnitř polyploidní čeledi Zingiberaceae byl řádně naplněn jak po formální, tak věcné stránce. Výstupem je 8 publikací. Další MS jsou připraveny k publikování. Pravidla GAČR byla dodržena.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2014
Ukončení řešení
5. 12. 2018
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
4. 5. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
12. 6. 2019
Finance
Celkové uznané náklady
10 544 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 544 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč