Organizace translokačního aparátu zabývajícího se biosyntézou podjednotek fotosystému II
Cíle projektu
Chlorofyl-vazné proteiny (PSII-CPs) jsou klíčovou strukturní komponentou fotosystému II (PSII), nicméně mechanismus jejich biosyntézy a také způsob zabudování chlorofylu zůstává nejasný. Pomocí proteinových kotev se nám podařilo izolovat velký proteinový komplex ze sinice Synechocystis 6803, který obsahuje Sec translokázu, chlorofyl syntázu a asembly faktory PSII. Očekáváme, že právě tento komplex odpovídá v buňce za produkci PSII-CPs a jeho charakterizace je primární náplní projektu. Konkrétně se zaměříme na strukturní a funkční problematiku s cílem: a) identifikovat jednotlivé proteinové podjednotky komplexu, kvantifikovat asociované pigmenty a získat strukturu komplexu s nízkým rozlišením pomocí single-particle analýzy. b) definovat funkci vybraných proteinů, jejichž přítomnost v komplexu jsem již potvrdili (PAM68, HliD, Slr1870). Na řešení projektu zapojíme široké spektrum metod jako je hmotnostní spektroskopie, 2D elektroforézy, single-particle analýzu, či izotopové značení proteinů a chlorofylu. Tyto techniky budou kombinované s využitím mutantů sinic.
Klíčová slova
chlorophyll-binding proteinsphotosystem II subunitstransloconcyanobacteriachlorophyllprotein-protein interactions
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
14-13967S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Organization of translocon machinery engaged in the biosynthesis of Photosystem II
Anotace anglicky
The key structural components of Photosystem II (PSII) are large chlorophyll-proteins (PSII-CPs), however the way they are synthesized and preloaded with chlorophylls remain unresolved. Using epitope tagging we have purified a large protein complex from the cyanobacterium Synechocystis 6803, which contains Sec translocase, ribosomes, chlorophyll synthase and PSII assembly factors. We expect this complex represents apparatus responsible for the PSII-CP synthesis and its characterization is the primary objective of this project. Particularly, structural and functional issues will be addressed: a) to identify individual protein subunits, quantify associated pigments and to obtain a low-resolution structure by single particle reconstruction. b) to define function of selected proteins (PAM68, HliD, Slr1870) already found to be components of this protein machinery. A broad spectrum of methods will be employed like mass-spectrometry, 2D gel systems, single particle analysis and protein- and chlorophyll-labelling. This will be combined with using of advanced cyanobacteria mutants.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cílem projektu bylo studium aparátu podílejícího se na biosynthese podjednotek fotosystému II (PSII) vázaných na chlorofyl u modelové sinice Synechocystis 6803. Projekt přispěl významně k pochopení úlohy inkorporace chlorofylu pro proces biogeneze PSII. Výsledky byly publikovány v pěti článcích v časopisech s dobrým až vynikajícím impaktním faktorem.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2014
Ukončení řešení
31. 12. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
17. 3. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
4 314 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 314 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
4 314 tis. Kč
Statní podpora
4 314 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2014 - 31. 12. 2016