Studium struktury a klíčových interakcí vedoucích k tvorbě nezralých retrovirových částic pro testování a racionální návrh inhibitorů skládání HIV.

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Hlavní účastníci
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.<br>Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
14-15326S

Název projektu anglicky
Study of structure and interactions critical for formation of immature retroviral particles for testing and rational design of HIV assembly inhibitors
Anotace anglicky
Assembly of immature retroviral particle is driven by oligomerization of polyprotein precursor, which is upon virus release, cleaved into structural proteins that rearrange into mature, infectious particle. Immature particle formation is mediated by mutual interactions of N- and C-terminal subunits (NTD and CTD, respectively) of capsid protein (CA) as well as nucleocapsid protein and nucleic acids. This proposal originates from the 8Å structure of immature particle with substantially distinct CA-CA interactions from those in mature virion. We will characterize in detail CA regions critical for formation of immature and mature particles and interactions participating in their stabilization. We will use rational in silico inhibitor design to search for the assembly inhibitors. The activity of selected inhibitors will be evaluated using our assay kit. The CA interaction interfaces with inhibitors will be determined using NMR spectroscopy. The best inhibitors will be tested for their cytotoxicity and effect on HIV-1 infectivity.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zaměřil na studium interakcí důležitých pro skladbu retrovirových částic. Projekt byl řešen v souladu s návrhem, vyústil v publikaci šesti původních článků. Grantová pravidla byla v průběhu řešení dodržována.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017

Podobné projekty(10)