Skryté relevantní funkční dráhy v odpovědi hostitele na infekci Leishmania zjištěné pomocí cílených genomických konstruktů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-30186S

Název projektu anglicky

Hidden relevant functional pathways in host response to Leishmania infection revealed in focused genomic constructions

Anotace anglicky

Leishmaniasis is a paradigmatic complex disease with multiple symptoms and large individual variation. We studied the pathways and gene expression patterns controling this variation in CcS mouse strains, carrying different subsets of 12.5% genes of the resistant strain STS on the susceptible BALB/c genetic background. Unexpectedly we found several functional pathways in infected CcS-20 mice, which are not activated in its parents BALB/c and STS. Other CcS strains may also exhibit pathways regulating their individual responses but not activated in BALB/c and STS. This novel type of gene expression control cannot be deduced from data involving whole genome differences. We will correlate the new expression patterns with presence of leishmaniasis susceptibility genes and immunological and metabolic tests to define the responsible functional genetic networks in spleen and macrophages. This will identify the regulatory switches that determine individual susceptibility and provide qualitatively new insights into genetics of responses to infection, and control of gene expression in general.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EC - Imunologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

K problematice hodnoceného projektu byly dosud publikovány tři kvalitní práce, z nichž recentní publikaci v prestižním časopise Frontiers Immunology lze považovat za stěžejní. Další zaslaná publikace a přijatý patent s projektem souvisí jen částečně . Vzhledem k překryvu publikací s navazujícím projektem řešitelky lze tento projekt hodnotit pouze jako splněný.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

23. 4. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

5 978 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 978 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč