Mikrobiální meta-omika v souvislosti s fungováním ekosystémů: role populací a jejich metabolických drah v degradaci chlorethenů

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Hlavní účastníci
Technická univerzita v Liberci / Ústav pro nanomateriály, pokročilé technologie a inovace<br>Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
14-32432S

Název projektu anglicky
Linking microbial meta-omics with ecosystem functioning: populations and pathways involved in chloroethenes degradation
Anotace anglicky
Chlorinated ethenes (CE) have been used as effective non-flammable solvents. Therefore, they are widespread persistent pollutants of soils and waters. Degradation of CE often results in the formation of more toxic compounds. Mechanism of their formation and degradation still remains rather unclear. This study aims to link specific microorganisms, genes, and metabolites to in situ CE degradation activities. Modern high throughput sequencing methods along with techniques of functional microbial ecology (e.g., stable isotope probing, SIP) enable new insights into the complexity of such mechanisms. SIP will select the populations directly involved in the assimilation of CE, microbial meta-omics will clarify the functionality of the communities, including phylogenetic diversity (metagenomics) and metabolic diversity (metatranscriptomics, metaproteomics). The outputs of the project will include metabolic pathways mapping and identification of genes involved in the degradation of CE in real environmental conditions.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cíle projektu byly splněny. Byly charakterizovány bakteriální kmeny schopné reduktivní dehalogenace na kontaminované lokalitě a zavedeno široké spektrum molekulárně genetických markerů popisujících přítomná mikrobiální společenstva. Výsledky byly publikovány v šesti článcích v mezinárodních časopisech a v jednom národním časopise.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
12. 6. 2019

Podobné projekty(10)