Protein HMGB1: vliv na na dynamiku nukleozomů a vazbu transkripčních faktorů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-01354S

Název projektu anglicky

HMGB1 protein: involvement in nucleosome dynamics and transcription factors binding

Anotace anglicky

Storage of eukaryotic DNA in nuclei requires tightly coiling and compaction in the form of chromatin (an array of nucleosomes stabilized by histone H1). Access of regulatory factors to their specific DNA binding sites is achieved by loosening/disruption of the nucleosome structure by ATP-dependent remodeling complexes. Chromatin remodeling and binding of a number of transcription factors to DNA is stimulated by chromatin-associated protein HMGB1. Recently we have demonstrated that redox state of HMGB1 can modulate the ability of the protein to displace H1 from naked DNA [PlosOne 9:2 e89070(2014)]. Here, we intend to study the impact of different redox state of HMGB1 on (i) nucleosome dynamics, (ii) histone H1 displacement from nucleosomes, and (iii) specific binding of selected transcription factors to nucleosomes (in the presence or absence of RSC chromatin remodeler) by a number of advanced techniques. Obtained results will contribute to understanding of HMGB1 involvement in local destabilization of chromatin, recruitment of regulatory proteins and transcriptional activation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Podařilo se prokázat, že vazba histonu H1 na DNA je negativně modulována proteinem HMGB1 v závislosti na jeho redoxním stavu a byla objasněna schopnost ohýbat DNA pro vazbu transkripčního faktoru p53 na DNA in vitro a transaktivaci genů regulovaných tímto transkripčním faktorem. Navíc se podařilo zjistit vliv deregulované exprese proteinu HMGB1 v lidské buňce.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

4 844 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 844 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč