Určení buněčné role HelD, nového vazebného partnera bakteriální RNA polymerázy.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-05228S

Název projektu anglicky

Deciphering the Cellular Role of HelD, a Helicase-like Protein Associated with Bacterial RNA Polymerase.

Anotace anglicky

Correct regulation of gene expression is key for survival of the cell. Bacterial RNA polymerase (RNAP) is the central enzyme of gene expression. The activity of RNAP can be altered by a number of factors, and these factors are critical for correct gene expression. We recently discovered in Bacillus subtilis a novel helicase-like protein, HelD. We showed that it binds to RNAP and stimulates its activity (Nucleic Acids Res [2014] doi 10.1093/nar/gku113). Here, we propose to structurally characterize HelD, identify its genome-wide transcriptomic effects, and advance our understanding of the mechanistic details of HelD’s functioning in particular, and thus of the transcriptional machinery and gene expression regulation in general.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Tříletý standardní projekt přinesl výsledky, které se týkaly studia úlohy proteinu HelD v interakci s RNA polymerázou. Plánovaných cílů projektu se podařilo dosáhnout a získané výsledky byly publikovány v celkem 4 publikacích s kumulativním IF větším než 69 včetně časopisu Nature a Molecular Cell.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

8 323 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 323 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč