Regulační úseky nukleových kyselin - polymorfismus, dynamika a interakce

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta<br>Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-06785S

Název projektu anglicky

Nucleic Acid Regulatory Sequences - polymorphism, dynamics, and interactions

Anotace anglicky

The project is aimed at detail investigation of structural arrangement, formation of biologically relevant complexes, and dynamics of selected representative types of nucleic acid regulatory sequences - DNA guanine quadruplexes, miRNA sequences, and DNA transcription elements containing CArG box – in order to elucidate the molecular mechanism of their regulatory function and its control by external factors, namely molecular crowding, temperatures and charge compensating molecular surrounding. The nucleic acid segments and/or their complexes with key proteins will be studied by means of SPR biosensing, Raman and NMR spectroscopy, CD spectroscopy, Raman optical activity, and molecular dynamics simulations. These methods will be optimized and the experimental and theoretical approaches further developed for advanced investigation of nucleic acids.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíle projektu byly dosaženy. Byly získány nové poznatky v oblasti struktury a dynamiky nukleových kyselin. Výsledky snesou mezinárodní srovnání. Byly také vypracovány nové metodické postupy. Výsledky byly publikovány v 8 článcích (JIMP). Finanční prostředky byly využity účelně.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

11 631 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 631 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč