Nové reaktivní skupiny zavedené do nukleových kyselin pro modifikaci oxokomplexy osmia: strukturní a analytické aspekty
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-08434S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Novel reactive groups introduced in nucleic acids for modification with oxoosmium complexes: structural and analytical aspects
Anotace anglicky
Nucleic acids (NAs) containing synthetic nucleobase derivatives bearing reactive groups to form nitrogenous ligand-stabilized osmate adducts upon reaction with osmium tetroxide (reacting with unsaturated C-C bonds) or potassium osmate (reacting with cis-1,2 diols) reagents will be prepared. The novel reactive moieties will include 7-deazapurines, pyrimidine glycols and nucleobase conjugates with external substituents (at C5-position in pyrimidines or C7-position in 7-deazapurines) presenting the above mentioned reactive groups. Modification of such functionalized NAs with the osmium reagents will be studied with respect to the type of introduced reactive group, NA structure, stabilizing ligand type and other conditions. Electrochemical properties of the NA-osmium adducts will be studied in detail to develop facile bioassays based on NA post-labeling with the osmium species, applicable in studies of NA interaction with proteins or small molecules affecting the NA structure, in detecting products of oxidative damage to DNA and for other purposes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CB - Analytická chemie, separace
CEP - vedlejší obor
CG - Elektrochemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byly vypracovány postupy pro syntézu nukleobází modifikovaných alkeny, alkyny, dioly, cukernými zbytky a jejich následné zavedení do struktury DNA. Byla prokázána reaktivita těchto zavedených funkčních skupin s oxokomplexy osmia, čehož lze využít pro studium poškození a interakcí DNA elektrochemickými metodami. Praktické aplikace však nebyly vyvinuty. Výsledky byly publikovány formou dvou článků.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2015
Ukončení řešení
25. 4. 2019
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
5. 4. 2017
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
2. 7. 2020
Finance
Celkové uznané náklady
7 935 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
7 935 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč