Fosfoinositidové kompartmenty v buněčném jádře: struktura a funkce

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-08738S

Název projektu anglicky

Phosphoinositide compartments in the cell nucleus: structure and function

Anotace anglicky

DNA transcription is critically dependent on the spatial organization of the nucleus. Although a lot is known about the protein-DNA interactions involved in the maintenance of intranuclear order, the evidence for lipid contribution to this crucial process is missing. We have previously shown that a phosphoinositide - phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PI(4,5)P2) - promotes rDNA transcription and contributes to the structural maintenance of the nucleoli. In this project, we plan to map the localization and binding partners of various phosphoinositides (PIs) in the nucleus to identify their particular functions. Our preliminary data revealed that PI(4,5)P2 forms discrete foci in the nucleoplasm. We will analyze their molecular composition and their role in nuclear processes with the emphasis on transcription. We will uncover the cross-talk between various nuclear PIs and compare their distribution in various cell lines, tissues, and stages of cell cycle. It seems that PIs foci represent novel nuclear compartments that affect genome architecture and thus DNA transcription.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Získané poznatky popisují nové lipidové struktury v jádře - lipidové ostrůvky, které jsou s velkou pravděpodobností zapojeny do genové exprese a přepisu genů. Jsou podkladem pro další výzkum v této oblasti a mohou se stát potenciálním cílem farmakologického ovlivňování pochodů genové exprese. Výsledky byly publikovány v 5 impaktovaných pracích a jsou důležitým přínosem pro daný vědní obor.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

9 918 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 918 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč