Modus operandi cytokinin-vnímajících histidin kinas v rostlinách
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Hlavní účastníci
Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta<br>Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-19266S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Modus operandi of cytokinin-sensing histidine kinases in plants
Anotace anglicky
Two-component signaling (TCS) pathway is a widespread sensor and intracellular signaling system in prokaryotes, lower eukaryotes and plants. In plants, the sensing components of TCS, membrane bound sensor histidine kinases (HKs), act as receptors of a key hormone cytokinin (CK). We propose to employ the CK receptors as a model to elucidate functional architecture of ligand binding domains of HKs. Integrated employment of in silico (bioinformatics, molecular modeling and molecular docking) and experimental (rational protein design, combinatorial saturation mutagenesis and focused directed evolution) approaches will yield novel HKs. Combination of the HKs with our already existing unique library of natural and artificial ligands will form two dimensional array for high-throughput specificity cross-testing, to discover novel specificity patterns in the HKs. This will significantly contribute to currently rudimentary knowledge of HK specificity and form a base for engineering TCS for applications in biotechnology and synthetic biology.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt přispěl k objasnění strukturně-funkčních charakteristik vazebné domény pro ligand u membránově vázané histidinové kinázy (AHK4), souvisejících s její úlohou v přenosu signálu zprostředkovaného cytokininy v rostlinách. Během 3let trvání projektu byly publikovány 3 práce v kvalitních časopisech, další rukopis byl zaslán do recenzního řízení a byla podána přihláška patentu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2015
Ukončení řešení
31. 12. 2017
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
27. 4. 2017
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
4. 5. 2018
Finance
Celkové uznané náklady
9 576 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 576 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč