Vliv konformačních motivů a epigenetických modifikací na DNA vazebné vlastnosti proteinů rodiny p53

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-21855S

Název projektu anglicky

Influence of conformation motifs and epigenetic modifications to DNA binding properties of p53 family proteins

Anotace anglicky

An altered pattern of epigenetic modifications is central to many common human diseases, including cancer. DNA methylation, histone deacetylation, and methylation of histones are often associated with a repressed chromatin state and with the silencing of gene expression. In this project we will study influence of epigenetic modifications and local DNA structures (cruciform, triplexes and quadruplexes) on protein-DNA interaction. We will pursue a systematic study of the complexes between DNA and their binding partners from biochemical characteristic in vitro to its localization in the cell lines. The knowledge resulted from proposed study will allow to better understand how protein-DNA interactions maybe regulated by post translational modifications and with local DNA structures. We assume that our results will enhance our understanding of the molecular basis of cancer.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt umožnil detailní charakterizaci DNA vazebných vlastností proteinů rodiny p53 na lokální struktury DNA a na vazbu s cílovými sekvencemi s inverzními repeticemi, které vytváří křížovou strukturu. Řešení projektu je hodnoceno jako vynikající.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

6 795 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 795 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč