Analýza replikačních bloků viru Rousova sarkomu v nepermisivních buňkách a určení faktorů přispívajících ke spuštění virové produkce
Cíle projektu
Jednou ze současných priorit ve virologii obecně a retrovirologii obzvlášť je porozumět tomu, které buněčné faktory se účastní kontroly horizontálního šíření virů. Nedávno jsme popsali na molekulární úrovni, které bloky při virové replikaci pozorujeme v nepermisivích křeččích buňkách transformovaných ptačím virem Rousova sarkomu (RSV) a jaké změny nastanou při spuštění virové produkce po fúzi s permisivní kuřecí buňkou. V této aplikaci navrhujeme pokračovat ve studiu obnovení virové produkce s důrazem na popis, jaká omezení pozorujeme u buněk různých ptačích druhů ve schopnosti spustit virovou produkci ze savčích buněk. Nicméně našim hlavním cílem je určit, které kuřecí faktory přispívají ke spuštění virové produkce v savčích buňkách. V této souvislosti navrhujeme dva různé přístupy. První z nich je založen na studiu RSV regulačních RNA elementů a nalezení proteinů, které se na ně vážou. Druhý z nich využívá radiačních hybridů kuře-křeček, pomocí nichž chceme zjistit, které části kuřecího genomu jsou nutné k překonání popsaných bloků při replikaci RSV v nepermisivních buňkách.
Klíčová slova
Rous Sarcoma Virusretrovirus heterotransmissionRNA splicing and export, restriction factorsRNA-binding proteinsendogenous retroviruses
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-22207S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Analysis of Rous sarcoma virus replication blocks in non-permissive cells and characterization of factors contributing to virus rescue
Anotace anglicky
One of the priorities of present day virology in general, and retrovirology in particular, is to get insight into the cell factors involved in the control of horizontal virus spreading. Recently we provided molecular characterization of cellular blocks involved in rodent cell non-permissiveness for avian Rous Sarcoma Virus (RSV) and changes after virus rescue by fusion of RSV-transformed rodent cells with permissive chicken cells. In the present application we propose to continue the study of virus rescue and describe the limits of distant avian species cells in their ability to trigger RSV rescue from mammalian cells. However, our main goal is to determine which chicken factor(s) contribute to RSV rescue from mammalian cells. We propose to use two different approaches. The first is based on the study of protein binding activity of critical RSV regulatory RNA elements. The second is based on employment of chicken-hamster radiation hybrids to find out which parts of the chicken genome are required for overcoming the described RSV replication defects in non-permissive cells.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10606 - Microbiology
10607 - Virology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Hlavním přínosem projektu je vytvoření modelu pro studium mezidruhového přenosu obalených virů, což je nový přístup, který se může uplatnit při studiu nově vznikajících virových infekcí. Řešení projektu se aktivně účastnili VŠ studenti, vznikly studentské práce a 1 odborný a 2 přehledové články s IF. Vše dle pravidel GAČR.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2015
Ukončení řešení
31. 12. 2017
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
5. 4. 2017
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
4. 5. 2018
Finance
Celkové uznané náklady
6 823 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 823 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
6 823 tis. Kč
Statní podpora
6 823 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EE - Mikrobiologie, virologie
Doba řešení
01. 01. 2015 - 31. 12. 2017