Chybné cílení somatických hypermutací a jeho vliv na nestabilitu genomu B lymfocytů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-24776S

Název projektu anglicky

Mistargeting of somatic hypermutation and its role in B cell genome instability

Anotace anglicky

Somatic hypermutation (SHM) introduces point mutations into immunoglobulin (Ig) genes in germinal center B cells during an immune response. The reaction is initiated by cytosine deamination by activation-induced deaminase (AID) and completed by error-prone processing of the resulting uracils. Although SHM is directed to the Ig locus by cis element DIVAC (DIVersification Activator), newly emerging studies report SHM activity to occur more genome-wide; thus SHM represents a threat to the genome integrity. We address this problem with our novel SHM reporter assay based on retroviral vectors bearing our specially designed fluorescence marker (GFP7a), which loses its fluorescence as a result of SHM activity in the cell. Our vectors will be utilized in the search for potential genomic non-Ig DIVAC elements and for analysis of SHM (mis)targeting and regulation. Genomic and epigenomic position effects on SHM will be studied and the SHM capacity of non-B cells will be assessed. Our results could provide a novel insight into the mechanism of SHM and its role in malignancies.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EC - Imunologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešitel doložil 3 publikace. Jako první byla předložena publikace v časopise Viruses. Zde řešitel vystupuje v roli spoluautora. Nově-publikovaný článek v Cell Reports přímo odpovídá cílům projektu se zásadním podílem řešitele. Další článek byl přijatý do tisku v časopise European Journal of Immunology. Zmíněné práce přináší zajímavé výsledky v daném oboru, a tudíž lze považovat projekt za splněný.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

29. 11. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2020

Celkové uznané náklady

4 771 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 771 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč