Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Struktura a dynamika organokovových komplexů v biologickém prostředí.

Cíle projektu

Výzkum reakčních mechanismů kovových iontů koordinovaných s oligonukleotidy a fragmenty proteinů a peptidů (biomolekul) na molekulární úrovni slouží k ověření platnosti a předpovědi základních vlastností a reaktivity zmíněných komplexů v biofyzikálních a biochemických procesech. Kvantově mechanické metody kombinované s molekulárním modelováním (QM/MM) jsou unikátním nástrojem pro takovéto studium. Navrhovaný projekt bude zaměřen především na otázky reakčních mechanismů a selektivity vazby kovů, včetně aspektů spojených s protinádorovou aktivitou vybraných sloučenin. Pro studium elektronového, strukturního i energetického popisu koordinace kovů v biomolekulách budou využity nejmodernější metody včetně programu QMS vyvinutého ve skupině navrhovatele a určeného právě pro molekulárně dynamické QM/MM simulace. Pro ověření správnosti navržených mechanismů bude rovněž provedena řada experimentální ITC, IR, CD a NMR měření. Kalorimetrické i strukturní informace získané v těchto měření jsou přímo porovnatelné s výsledky výpočetních modelů.

Klíčová slova

bioinorganic-complexes interactionsdensity-functional methodscombined QM/MM-calculationsmolecular-dynamicstheromynamicskinetics

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Grantová agentura České republiky

  • Program

    Standardní projekty

  • Veřejná soutěž

    Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

  • Hlavní účastníci

    Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

    16-06240S

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Structure and dynamics of organometallic complexes in bio-environment.

  • Anotace anglicky

    Reaction mechanisms of metal cations coordinated with oligonucleotides or fragments of peptides, and proteins (biomolecules) at molecular level helps to validate and/or predict properties and reactivity of metallocomplexes in biophysical and biochemical processes. Quantum mechanical methods combined with molecular mechanics (QM/MM) are a unique tool for such studies. The proposed project will concentrate mainly on reaction mechanisms and binding selectivity including aspects connected with anticancer activity of selected compounds. Modern methods, including our recently-developed programs QMS designed for such MD QM/MM simulations, will be used for the electronic, structural and energetic description of metal coordinations in biomolecules. In order to verify suggested mechanisms, a series of experimental ITC, IR, CD and NMR measurements will be performed. Calorimetric and structural information obtained in such experiments can be directly compared with computational results.

Vědní obory

  • Kategorie VaV

    ZV - Základní výzkum

  • CEP - hlavní obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • CEP - vedlejší obor

  • CEP - další vedlejší obor

  • OECD FORD - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    10403 - Physical chemistry

Hodnocení dokončeného projektu

  • Hodnocení poskytovatelem

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Zhodnocení výsledků projektu

    V souladu s návrhem projektu byla pomocí výpočetních metod studována struktura, vlastnosti a transformace řady komplexů kovů. Bylo dosaženo zajímavých a hodnotných výsledků, které byly publikovány celkem v 11 pracích. Pro sadu Pt(IV) komplexů bylo provedeno porovnání vypočtených a experimentálních dat. Cíle projektu byly splněny a projektu je možno udělit absolutorium.

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 2016

  • Ukončení řešení

    22. 7. 2020

  • Poslední stav řešení

    U - Ukončený projekt

  • Poslední uvolnění podpory

    25. 5. 2018

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP21-GA0-GA-U/06:1

  • Datum dodání záznamu

    30. 6. 2021

Finance

  • Celkové uznané náklady

    4 989 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    4 188 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    801 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    0 tis. Kč

Základní informace

Uznané náklady

4 989 tis. Kč

Statní podpora

4 188 tis. Kč

83%


Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

CEP

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

Doba řešení

01. 01. 2016 - 22. 07. 2020