Distribuce biomolekul studovaná v jednotlivých buňkách a vnitrobuněčně u časných stádií drápatky pro objasnění mechanismu asymetrického dělení

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-07500S

Název projektu anglicky

Distribution of biomolecules studied on single cell and subcellular levels in Xenopus early stages to reveal mechanisms of asymmetric cell divisio

Anotace anglicky

Asymmetric division is a property of eukaryotic cells that is fundamental to the formation of higher life forms. Despite its importance the mechanism behind remains elusive. Asymmetry in the cell is induced by polarization of cell fate determinants that become unevenly distributed among progeny cells. Currently, only few determinants have been identified. Xenopus laevis is an ideal system to study asymmetric cell division during early development, because of the huge size of its oocytes and early stage blastomeres. We have developed technology to measure distribution of critical biomolecules within the early development. This unique platform will be used to measure the distributions of coding and noncoding RNAs, as well as proteins throughout development from the oocyte to the 16-cell embryos. This will produce the first 3-dimensional temporal expression map with single cell and even subcellular resolution of the three types of biomolecules expected to be critical for the determination of cells’ fates giving rise to the animal-vegetal, dorsal-ventral, and left-right asymmetries.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt měl tři cíle a všechny byly úspěšně splněny. Nejdůležitějším výsledkem je kompletní transkriptomická a proteomická analýza oocytů Xenopus laevis s následnou rozsáhlou bioinformatickou analýzou UTR oblastí. Jedná se o první publikaci popisující novou skupinu lokalizovaných RNA, které jsou předpokládanými regulátory vývoje ektodermu.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 5. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

6 273 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 171 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

102 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč