Babylonská věž: Interakce mezi mitochondriemi a jádrem u gynodiécické rostliny silenka obecná, zkoumané pomocí transkriptomiky.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-09220S

Název projektu anglicky

Tower of Babel: Mitochondrial-nuclear interactions in the gynodioecious species Silene vulgaris investigated with transcriptomics.

Anotace anglicky

Plant mitochondrial genomes are highly rearranged. We propose to utilize an unprecedented level of intraspecific diversity in plant mitochondrial DNA described in Silene vulgaris for the investigation of mitochondrial-nuclear interactions. Cytoplasmic male sterility (CMS), underlying a wide-spread plant reproduction system gynodioecy, represents a special case of these interactions and is particularly interesting owing to its importance in agriculture. We will apply the transcriptomic approach (Illumina sequencing) for the global comparison of both mitochondrial and nucleus-derived transcriptomes. We will clarify the pathways followed by specific CMS types to achieve male sterility. We will analyze the association between the expression of mitochondrial and nuclear factors and their possible co-evolution. Finally, we will estimate evolutionary rates of selected nuclear genes (e.g. encoding pentatricopeptiede repeat proteins) involved in mitochondrial regulations to reveal nuclear consequences of the extraordinary high within-species mitochondrial DNA diversity.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt zjistil rozdíly v transkripci mitochondriálních i jaderných genů samičích a oboupohlavních rostlin dvou linií silenky a jejich kříženců a identifikoval geny, jež mohou za cytoplazmatickou samčí sterilitu. Výstupem po odložení hodnocení je pět článků ve významných časopisech, přínosných pro obor rostlinné genetiky, některé poslouží pro doktorskou dizertaci členky týmu.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

22. 7. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

4 964 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 857 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

107 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč